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手把手教你单细胞测序分析实战1、数据读取： 以GSE106273为例： 下载三个combined文件，修改文件名：Matrix文件改为“matrix.mtx.gz”（这个文件是对基因的表达量），gene...
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2020-06-04 一寸，二寸照片的处理
2寸尺寸为5.3x3.5,1寸尺寸为3.5x2.5，单位是cm 最好拍照的时候拍好，注意穿衣服的颜色，背景墙的颜色，坐姿及拍照姿势这些，否则后期会非常麻烦。 怎样通过PS将一...
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TCGA-Sample Type Codes等基础信息https://begin4learn.gitbooks.io/note-of-cancer-tcga-data-analysis/content/Tools/TCGACod...
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TCGA数据下载与ID转换教程 https://www.sci666.com.cn/45780.html
GENCODE：https://www.gencodegenes.org/
Homo_sapiens.GRCh38.99.chr.gtf.gz：http://ftp.ensembl.org/pub/release-99/gtf/homo_sapiens/
GEPIA2详解（中国智造-肿瘤数据库）：https://www.sci666.com.cn/46658.html2022-04-25 TCGA下载(XENA)、ID转化等问题
预后信息下载可使用：Curated版本（在TCGA下面），表达矩阵可使用GDC版本的FPKM（在GDC）下面（如TCGA-LUAD.htseq_fpkm.tsv.gz，实际下...
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2022-04-25 GSVA相关
GSVA的运行注意事项如果是芯片的数据是需要对数据进行过滤的，可以参考下面的测试数据代码，或者看官方的文档GSVA本身提供了三个算法，一般使用默认的算法就可以了对于RNA-s...
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参考：
读取大文件（如Xena数据的pancancer）和选择性读取某些列：
https://www.jianshu.com/p/337d7939c3b7
ensembl_id转换之两种方法比较（利用数据库的注释文件或org.Hs.eg.db包）：
https://www.jianshu.com/p/3c290fee634f
怎么实现ID转换https://www.jianshu.com/p/98dd5b704105
参考基因组及注释文件下载：
转录组直播课学习：第三天
https://www.jianshu.com/p/718160ca94932022-04-25 TCGA下载(XENA)、ID转化等问题
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2022-04-25 TCGA下载(XENA)、ID转化等问题
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人基因组在NCBI、UCSC、ENSEMBL、GENCODE、千人基因组等各数据库的版本对应1、人基因组在NCBI、UCSC、ENSEMBL、GENCODE数据库的版本对应 在用到人基因组相关信息时，经常用到的数据库有NCBI、UCSC、ENSEMBL。 NCBI的...
