生物医学研究中总免不了对单基因或是某基因家族的分析，这样“优秀”的基因需要在疾病表达、临床病理特征、以及其他生物层面具有显著的意义，如免疫相关、浸润差异、突变差异等等，同时具...
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五分钟看完：怎样不读文献而快速找到值得研究的基因？ -
下载转录组数据的方法
在阅读文献时，会得到一些转录组的数据。那么我们如何下载这些转录组数据呢？以SRR1039510为例 一般转录组分析都会在服务器上进行，所以在下载之前，需要配置好环境，下载好相...
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TCGA 01 TCGAbiolinks下载转录组数据差异分析1. 准备 安装和导入TCGAbiolinks包 查看各个癌种的项目id，总共有65个ID值 查看project中有哪些数据类型，如查询"TCGA-LUAD"，有7种数据类型...
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Python+Selenium，让浏览器自动帮你下文献在做学术、搞科研的过程中，我们往往需要针对一个特定的主题下载海量的文献。在把几百篇文献下载到电脑的过程中，假如遇到不够友好的数据库不提供批量下载的功能，怎么办？我恰好遇到了这...
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《生物信息学生R入门教程》读书笔记 Chapter 7这一章来介绍NGS的下游分析 富集分析 简单的讲，富集分析就是一种统计分析的手段，用来筛选功能相类的一组基因是否富集中差异表达的基因中。当人们拿到了差异表达的基因时，很多时候...
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GO和KEGG学习笔记1（含R代码）
材料：一个只有gene name的表格 需求：KEGG富集分析 背景 功能富集分析：按照功能分类，将功能相近的基因/蛋白分到一起，并关联其生物学表型。 Gene Ontolo...
