请问我跑roary时出现这样的错误：MSG: Got a sequence without letters. Could not guess alphabet。我通过排除法知道是哪一个基因组导致了这个错误，但是我检查了fasta文件该基因组没有问题，请问是什么原因该怎么解决呢
核心基因提取：prokka、roary和TBtools的联合运用首先，下载好基因组的完成图（自己的也行，只要确保测序质量够好），先用prokka注释完获得*.gff文件（批量可以参考我之前的文章用autoprokka执行），将gff文件放...
@小白菜学生信 好滴，谢谢你，但是roary太慢了😂
BPGA分析细菌泛基因组导读 BPGA是Bacterial Pan Genome Analysis tool的简写，16年发表的工具，17年最后一版更新，内置KEGG COG数据（老了），依赖use...
博主你好，我的113个全基因组数据用BPGA可以正常运行，但是当数量多时（200多个），会报错提示：Illegal division by zero at /home/ylf/pangenome_tool/BPGA-1.3-linux-x86_64-0-0-0/BPGA-Version-1.3/lib/std/cavaexecscript/BPGA-Version-1.3.pl line 479, <FH2> line 4.
请问怎么解决呢
10-【BPGA】的安装和使用安装时间：2021.2.17 1. 简介 BPGA是一款快速的泛基因组分析软件。似乎好像在windows上安装较为方便。在Linux下没有conda安装版本，只能手动进行安装...
博主你好，全基因组数量少时（几十个），我的BPGA可以正常运行，但是当数量多时（200多个），会报错提示：Illegal division by zero at /home/ylf/pangenome_tool/BPGA-1.3-linux-x86_64-0-0-0/BPGA-Version-1.3/lib/std/cavaexecscript/BPGA-Version-1.3.pl line 479, <FH2> line 4.
请问怎么解决呢
BPGA分析细菌泛基因组导读 BPGA是Bacterial Pan Genome Analysis tool的简写，16年发表的工具，17年最后一版更新，内置KEGG COG数据（老了），依赖use...
@大坏蛋HYB 好的谢谢你，这个我解决了，但是我的输出文件里只有faa、fna、log和hmmer文件，没有gff和其他文件是为什么呢
autoprokka:使用prokka批量注释autoprokka.py这个Python脚本可以方便地批量地使用prokka去进行注释，自动按照输入文件名去命名输出文件，并且每个样本单独一个文件夹存放注释后结果，.gff...
你好，修改第82行是直接执行subprocess.call命令吗?为什么我执行后显示command not found
autoprokka:使用prokka批量注释autoprokka.py这个Python脚本可以方便地批量地使用prokka去进行注释，自动按照输入文件名去命名输出文件，并且每个样本单独一个文件夹存放注释后结果，.gff...
