最近要玩一些新包，需要在4.0以上版本的R 里面跑，需要source安装包“Matrix”，各种报错。 make: *** [Matrix.so] Error 1 ld: w...
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Mac （11.0.1 ）升级 R 4.0.3 遇坑
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QNAP WEBDAV 权限问题解决
vi /etc/config/apache/extra/apache-dav.conf定位到你共享的文件名如我要共享 “soft" "Print“ 将Options Foll...
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不能用载体连接这一段序列，应该使用dcas9激活或者抑制。
如何通过CHIP-seq分析鉴别基因启动子和增强子
一、表观遗传学的组蛋白修饰 染色体一个核小体由两个H2A，两个H2B，两个H3，两个H4组成的组蛋白八聚体和147bp缠绕在外面的DNA组成。组蛋白有很多修饰形式，包括组蛋白...
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没.fa文件做什么都做不了啊。
如何通过CHIP-seq分析鉴别基因启动子和增强子
一、表观遗传学的组蛋白修饰 染色体一个核小体由两个H2A，两个H2B，两个H3，两个H4组成的组蛋白八聚体和147bp缠绕在外面的DNA组成。组蛋白有很多修饰形式，包括组蛋白...
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@是鸣 你要找一下自己的aspera装在哪里。
在Mac 和windows上用 Aspera Connect下载NCBI Sra数据
做生信分析在NCBI上下数据是第一步，不一定非要用linux下，装好sratools和Aspera Connect和都没问题。在这里NCBI SRA Toolkit找属于你版...
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在Mac 和windows上用 Aspera Connect下载NCBI Sra数据
做生信分析在NCBI上下数据是第一步，不一定非要用linux下，装好sratools和Aspera Connect和都没问题。在这里NCBI SRA Toolkit找属于你版...
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DNA甲基化分析----------甲基化比对软件专题（Bismark）我们在上个笔记中介绍了一些关于DNA甲基化的基本概念。那么如何去判断这个序列里面甲基化的信息呢？今天我们就来就这个话题好好聊一聊~--------------------...
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哪种遗传变异决定了组蛋白标记？
人类基因组中丰富的遗传变异不是在蛋白质编码基因中发现的，而是在非蛋白质编码区域内发现的。鉴于只有1％的基因组编码蛋白质，这并不奇怪。直到最近，确定遗传变异对性状变异和疾病的影...
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hic分析之分步工作原理参考之前的文章 hic分析之 hic-pro 介绍与安装 分步工作原理： 先看test文件 再看看opt文件 工作原理介绍： 1.Reads Mapping 将fastq文...
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hic分析之 hic-pro 介绍与安装
一、hic-pro是什么，参考网页： [GitHub] https://github.com/nservant/HiC-Pro[DOCUMENTATION] http://n...
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已知矩阵，制作RNA_motif的logo
这是一个很简单的诉求，可以用的方法有很多，今天谈一下MotifStack.介绍链接：MotifStack先弄清楚，motif的矩阵格式。 大家应该看明白了，motif的矩阵格...
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U17 snoRNA调节细胞胆固醇的转运
引言U17 snoRNA是第一个涉及胆固醇稳态调节的H/ACA snoRNA。已知H/ACA snoRNA靶向rRNA，tRNA和小核RNA（snRNA）以通过其远端环结合靶...
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snoRNA的新功能—参与调控mRNA 3’末端的加工
引言mRNA 3’末端加工是基因表达中必不可少的一步。经典的真核生物前体mRNA 3’加工是在由数十种反式作用蛋白组成的大分子机器内进行的。然而，RNA在这个过程中是否起作用...
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CircRNA的ceRNA机制研究文献解读
文献摘要:越来越多的证据表明环状RNAs（circRNA）是在肿瘤发生中起重要作用。然而，circRNA在三阴性乳腺癌（TNBC）中的功能在很大程度上是未知的。作者使用cir...
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细胞衰老克星-CircPVT1
Identification of senescence-associated circular RNAs(SAC-RNAs) reveals senescence supp...
