适用背景 单细胞转录组调控网络分析是单细胞转录组分析内容的高级分析之一，本文将介绍SCENIC/pySCENIC的流程，具体原理和内容不展开，主...
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四步完成单细胞数据调控网络流程分析-SCENIC/pySCENIC-2022-09-06 -
SCENIC-转录因子分析
今天写一篇关于单细胞转录因子的分析-scenic在做分析之前你应该看一下这篇文献，看看别人做了什么scenic分析《Single-cell RN...
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生信 | scATAC-Seq数据获取（超快sra转fq）部分代码参考自10x genomics官网[what-is-cell-ranger-atac]，但绝大多数代码融入了我自己的思考 1、上游分析（...
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【r<-函数】do.call的使用
do.call这个函数是我在搜索问题时会看到别人经常使用的一个函数，心生好奇，这次来看看它的用法。 从文档来看，do.call可以通过名字构建和...
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单细胞经典的课题设计思路
本文首发于单细胞天地[https://mp.weixin.qq.com/s/xihGDNTqVL27lk_47lPNIA] 一、单细胞的应用 根...
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从单细胞到空间转录组，生物医学进入新时代（转自 爱丽慕斯）编者按：随着10X genomics 于2019年11月发布Visium Spatial Gene Expression Solution，空间...
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【单细胞工具】-FIRM-整合多平台单细胞数据新算法单细胞rna测序(scRNA-seq)已被广泛应用于通过测量单个细胞的mRNA表达模式来发现新的细胞类型和重建发育轨迹。然而，使用不同的scRN...
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用Seurat做RNA Velocity安装加载相应的包 If you don't have velocyto's example mouse bone marrow dataset,...
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RNA velocity分析练习（三）生成loom文件
系列回顾：1.RNA velocity分析练习（一）文件下载以及预处理2.RNA velocity分析练习（二）软件安装 Velocyto软件针...
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单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：预处理与聚类scanpy 是一个用于分析单细胞转录组（single cell rna sequencing)数据的python库，文章2018发表在Geno...
专题公告
单细胞数据分析方法很多但要合理使用
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