hello，大家好，今天我们来分享一个做细胞通讯的分析软件NicheNet，这个软件最大特点就是预测配体活性，所以很多文章里都将NicheNet...

介绍这个包之前，先要搞清楚这个包能干啥。（部分内容摘抄自学术咖） Q1：WGCNA能干嘛？A1：能够将表达模式相似的基因进行聚类，并分析模块与特...

寻找差异表达的基因并识别它们的功能，是我们进行RNA测序的最主要目的。很明显，这些差异的基因必然与功能改变密切相关，例如，比较患病个体与正常个体...

============================================写在前面：可以参考另外一篇《得到差异基因后怎么做？[ht...

原创：黄小仙 小提琴图之前已经画过了，不过最近小仙又看到一种貌美的画法，决定复刻一下。文献中看到的图如下： Step1. 绘图数据的准备 首先要...

参考资料 南方医科大学网红博导Y叔的一本神奇的书https://yulab-smu.github.io/clusterProfiler-book...

这是一篇2018年发表在NBT上的文章，讲述的是两套单细胞数据如何去除批次效应 文章链接： 前言 由于不同的实验室，以及各个技术人员手法不同，在...

编者按：随着10X genomics 于2019年11月发布Visium Spatial Gene Expression Solution，空间...

作为一个生物学家(zha)，差异表达分析似乎是一项必备的技能。然鹅对于一个没有任何编程基础的生物学家，写代码是那么神秘莫测而又遥不可及，让人脑壳...