1.数据准备 用10x数据做scVelo，输入数据分2部分: Seurat 分析后的数据: 聚类、基因、细胞信息。 velocyto run 输...
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scVelo 的使用: 从bam和Seurat获取输入数据到画图
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(Vim) 复合命令、重复、回撤
一键双雕——复合命令 很多Vim的单键命令都可以被看成两个或多个其他命令的组合。下面是类似的一些例子，它们有什么共同点呢？ 当我们输入ko命令时...
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ATAC-seq基础知识（资源整理）ATAC-seq全名Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughpu...
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samtools-faidx用法
faidx： samtools faidxxxx.fa 能够对fasta 序列建立一个后缀为.fai 的文件 该命令对输入的fasta序列有一定...
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R数据可视化9:棒棒糖图 Lollipop Chart棒棒糖图，“望文生义”，就是长得像棒棒糖的图。听起来就很可爱是不是？今天就让我们一起欣赏一下棒棒糖图。 什么是棒棒糖图 首先让我们来看几张棒棒糖...
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Dapars寻找APA1.下载ref：https://github.com/ZhengXia/dapars/releases 2.github主页：https://g...
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celaref ||单细胞细胞类型定义工具Sarah Williams (2019). celaref: Single-cell RNAseq cell cluster labellin...
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单细胞转录组学习笔记-16-用Scater包分析文章数据
刘小泽写于19.8.20-第三单元第九讲：使用Scater包笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术...
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富集分析DAVID、Metascape、Enrichr、ClueGO前言 一般我们挑出一堆感兴趣的基因想临时看看它们的功能，需要做个富集分析。虽然公司买了最新版的数据库，如KEGG，但在集群跑下来嫌麻烦。这时网页...
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生信学习基础_R语言06_Matching reordering匹配与排序
原文地址：https://hbctraining.github.io/Intro-to-R/lessons/06_matching_reorde...
专题公告
常用生信软件，包括通用的R语言、python等，以及专用的samtools、annovar等
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