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群体遗传学习小组
收录了24篇文章 · 366人关注
  • pi, Fst, dxy, fd的计算

    有许多不同的统计量可以衡量差异选择的区域或基因渗入障碍的区域。这里介绍常用的四个统计量的计算： pi, 衡量遗传多样性 Fst, 衡量群体分化程...

    3.4 DumplingLucky 16 22
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    群体遗传笔记（一）：群体间选择信号的检测及GO注释

    从获取下机数据做质控、比对，到calling snp获得vcf文件这一步，网上已经有非常详细的教程，有GATK4.0和全基因组数据分析实践（上）...

    5.0 有梦的少年橙 13 65
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    重复一篇文献的GWAS（一）：基因型数据整理

    文献：A new regulator of seed size control in Arabidopsis identified by a g...

    4.7 TOP生物信息 7 45
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    群体遗传学-选择清除分析

    一、中性学说 分子水平上，生物的演化或物种的进化并不是自然选择引起的，而是由中性/近中性的突变等位基因经过遗传漂变引起的，从而形成分子水平上的进...

    5.2 Zhigang_Han 1 47
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    我的GWAS学习笔记

    上个月中旬，出于对GWAS的好奇，我参加了一个培训班，之后又花了一周的时间来整理听课笔记，感觉现在对GWAS已经有了一个比较全面的认识。 在ca...

    6.5 TOP生物信息 3 59
  • 群体遗传学的那些事儿（一）

    这周开始会陆续每周和大家分享一些和群体基因组学相关的知识（嗯，我又开始挖坑了）。本次推文先不进行具体知识的讲解，先从比较泛的角度去介绍一下群体基...

    1.3 lakeseafly 0 14
  • 群体遗传学的那些事儿（二）

    每周和你一起学习一些群体遗传的知识，每周和你一起进步，欢迎回来！上一回介绍完基本的群体遗传学的概念后，这周会给大家带来一些关于等位基因和基因型频...

    2.1 lakeseafly 1 18
  • LD衰减图的理解与应用

    在群体遗传学研究中，LD连锁不平衡分析是最常见的分析内容，也是关联分析的基础。如何正确理解并且进行相关的LD连锁不平衡分析是群体遗传中很基本的一...

    7.2 lakeseafly 14 92 2
  • Fst的计算原理与实战

    概念回顾 Fst：群体间遗传分化指数，是种群分化和遗传距离的一种衡量方法，分化指数越大，差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。 用于衡量种群分化...

    4.4 lakeseafly 16 54
  • Structure图的构建与理解

    介绍 什么是structure图？ 如果你有看过群体遗传相关的文章，你对它肯定不会陌生。对那些还没有接触过的同学，那就直接上图吧： 上图是选取于...

    2.3 lakeseafly 0 28