原发性肝细胞癌(HCC)术后复发率很高,5年内复发率约为70%。复发HCC的预后较差,早期复发患者5年生存率仅为23%。迄今为止,关于 HCC 术后复发机制的研究主要集中在基因组学和转录组学层面,缺乏对蛋白质水平的全面研究。近期,中山大学附属第五医院李丹研究员、单鸿教授和李曼研究员利用成像质谱流式 (IMC) 技术,全面描绘了原发和复发HCC的单细胞空间蛋白质组图谱,揭示了原发性和复发 HCC 之间空间蛋白组学景观的差异,并探索了复发机制。研究成果“Spatial proteomic landscape of primary and relapsed hepatocellular carcinoma reveals immune escape characteristics in early relapse ”发表在肝脏疾病领域专业期刊Hepatology上。
研究方法
IMC 技术描述46名患者的92个 HCC 样本(包括原发性PT和复发肿瘤RT)的细胞组成、细胞间相互作用、细胞邻近度和胶原/微血管形态;
使用机器学习算法,根据 IMC 数据预测早期复发 HCC 患者特征:一种新型树突状细胞亚群(PDL1+CD103+DCs);
联合 scRNA-seq 数据集分析 PDL1+CD103+DCs 的分子特征和功能;
mIHC 验证 PDL1+CD103+DCs 与早期复发的关系。
研究结果
1、IMC 全面描绘了原发和复发 HCC 的单细胞空间蛋白质组图谱为了了解原发性和复发性 HCC TME 的时空变化的分子认识,研究人员收集了46例 PT 和配对 RT 的 HCC 患者的92例手术肿瘤标本。通过33个 panel(涵盖了肿瘤细胞、免疫细胞、基质细胞等多种细胞类型,以及胶原蛋白和微血管形态等指标)全面描绘了原发和复发 HCC 的单细胞空间蛋白质组图谱。免疫细胞群的分布在 PT 和 RT 的各区域中均表现出差异性。随着距离肿瘤核心的距离减小,CD4+T 细胞成比例增加,而 CD8+T 细胞数量呈下降趋势;肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在 PT 和 RT 的三个区域均占主导地位,与 TM(肿瘤边缘)和 AN(相邻正常)相比,IT(肿瘤内)显著增加。同时,抗原提呈细胞(APCs)和树突状细胞(DCs)主要集中在 TM 中。
2、原发性和复发性 HCC 的细胞空间相互作用网络
在 PT 和 RT 的 TM 中,癌细胞和正常肝细胞显示出与免疫细胞相互作用的频率增加,在 RT 的 TM 中也观察到癌细胞与 EMT 之间的相互作用频率更高;复发 HCC 表现出更严重的免疫抑制特征,TME 中免疫抑制细胞(如 Tregs 和 Texs)数量增多。
3、识别与早期复发风险相关的空间特征
TM 区域的 TME 与早期复发密切相关,PDL1+CD103+DCs 在 TM 中富集,并与 Tregs 和 Texs 互作,促进免疫逃逸。PDL1+CD103+DCs 通过多种配体-受体途径与免疫细胞和肿瘤细胞相互作用,增强免疫抑制和免疫逃逸。
4、TM 中富集的 PDL1+CD103+ DCs与早期复发相关
为了阐明 PDL1+CD103+DCs 对 TME 的影响,研究人员比较了两类 TM 的 TME 内的细胞空间相互作用。随着 PDL1+CD103+DCs 比例的增加,癌细胞更有可能与 EMT 相互作用并逃离免疫群体。此外,TME 中 PDL1+CD103+DCs 比例较高与免疫抑制相关,这是由于免疫细胞和癌细胞之间的回避行为增加。此外,还观察到 DCs 与其他免疫群体(尤其是 Tregs、Texs 和 M2macs)之间的相互作用随着 PDL1+CD103+DCs 比例的升高而增强,这表明 PDL1+CD103+DCs 可能积极参与调节免疫网络。但在 AN 和 IT 中未观察到 TME 上的 PDL1+CD103+DCs。
5、以 PDL1+CD103+DC 为核心的免疫抑制相关多细胞微环境
鉴于 PDL1+CD103+DCs 与 TM 中的免疫抑制细胞(Tregs 和 Texs)之间存在很强的关联,接下来深入研究 PDL1+CD103+DCs 在 HCC TME 中的调节作用。研究人员收集了一个公开的 scRNA-seq 数据集。通过差异基因分析,确定了 PDL1+CD103+DCs 与其他 DC 亚型相比的保守基因标记。同时,基因集富集分析(GSEA)表明这些基因集中在与免疫反应、细胞粘附和细胞迁移相关的途径中,所有这些都与 HCC 的进展和转移密切相关;PDL1+CD103+DCs 与恶性细胞之间独特的配体-受体相互作用主要涉及与肿瘤进展相关的配对 。
总结
研究人员通过 IMC 技术分析了原发性和复发性 HCC 的空间蛋白组学特征,发现复发 HCC 肿瘤微环境呈现出一种侵略性、免疫抑制相关的空间生态系统,而肿瘤边缘的微环境与早期复发HCC风险增加密切相关。此外,还发现了一种新型的树突状细胞亚群(PDL1+CD103+DCs),该亚群在肿瘤边缘区域富集,并与早期复发 HCC 相关。该亚群与调节性 T 细胞和耗竭性 T 细胞相互作用,通过多种配体-受体途径增强免疫抑制和免疫逃逸。该研究结果为理解 HCC 复发机制和开发新型免疫治疗策略提供了重要的理论基础。
[参考文献]Yang M, Song X, Zhang F, et al. Spatial proteomic landscape of primary and relapsed hepatocellular carcinoma reveals immune escape characteristics in early relapse. Hepatology. 2024 Jun 20.