R语言基础
一、准备工作
1、确定或修改电脑用户名为英文
2、下载R和Rstudio
用搜狗微信搜索:“果子学生信 给自己一个全新的R语言环境”
二、认识R和Rstudio
1、R是一种编程语言,也是统计计算和绘图的环境,它汇集了许多函数,能够提供强大的功能。R语言软件界面简陋,通常不直接使用,而是用图形界面的Rstudio。(来源:微信公众号 生信星球)
三、尝试做图
作图只需要知道图的名字,知道用的什么R包即可自行探索;但用别人的代码套在自己的数据上,需要一定的R语言功底和解决报错的能力。
1、命令:plot(rnorm(50)),回车
2、命令boxplot(irisSpecies,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))
注:iris是一个R语言自带的数据框,通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据。以此类推。(来源:微信公众号 生信星球)
四、设置字体大小
Tools——Global Options——Appearance——14号——Apply
五、R语言基本操作
1、用Rproject管理工作目录
工作目录就是默认的读取和储存位置,也就是说,R语言只能和一个文件夹进行互动,这个文件夹非常重要,做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑,找不到。(来源:微信公众号 生信星球)
查看这一篇,养成好习惯https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA
2、显示文件列表,命令:dir()
直接打命令不跟路径,会显示默认路径,也就是工作目录,相当于linux的ls。
空的工作目录会显示:character(0)
工作目录下新建一个yun.txt.,会显示:[1] "yun.txt"
3、加减乘除
4、赋值
赋值符号用<-,这是小于号加上减号,也可以按Alt加上减号:x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x, 赋值后,x会显示在右上角的框,Environment里的Value列表里
直接输入x 回车,就会把x的值(3)打印到控制台上,前面的那个[1]是结果的第一个,不用管他。
5、删除变量(标点、括号等都必须是英文的)
a<-3
b <- 1
c <- 4
u <- 5+6
rm(b)
rm(u,c)
rm(list = ls())#清空所有变量
6、列出历史命令,
history()