前面已经讲完受体、配体以及对接位置的确定，下面开始正式对接的部分
1 对接文件的准备，在对接文件中写好受体、配体名称，对接中心点坐标，及距离等信息；
2 这些信息都要根据个人具体情况填写，其中有必须性和选择性填写两部分，以上为必须填写内容，可以根据vina软件说明填补其他的内容；
3 将对接文件及处理好的蛋白和配体文件放进自定义文件夹中；
4 使用命令提示符，输入命令vina --config conf.txt，即可开始分子对接过程；
5 分子对接过程开始运行，输出对接得分，以上共输出9个可能的结构，文件夹中也会输出一个out文件；
6 将输出文件放入pymol中，即可看到这9个对接结构位置；
以上就是就是整个Vina分子对接的过程，后续涉及到就是对接结果后期的图生成了，后面会慢慢向大家介绍。有问题请关注木初或者直接留言即可，谢谢大家。
