1 安装Pymol使用Python编写的,所以在安装该软件之前,要把python先安装好。 注意,安装过程中最好不要修改路径,直接默认安装就好。...
前面已经讲完受体、配体以及对接位置的确定,下面开始正式对接的部分 1 对接文件的准备,在对接文件中写好受体、配体名称,对接中心点坐标,及距离等信...
前面几个内容是指蛋白和小分子的处理过程,接下来一个非常重要的步骤是如何确定对接的位点,这也是整个分子对接过程中的重点。如果你能够找到原结晶的配体...
前面的一节中,已经介绍完Vina分子对接中大分子的预处理过程;这一节中主要介绍小分子的对接前的预处理的步骤。所用到的预处理软件仍然是Autodo...
上面几节,已经讲完分子对接得准备阶段及软件安装的过程,后面面对第一个问题就是蛋白大分子得预处理,下面简单得介绍下主要的步骤。 1 在执行vina...
上一节介绍到分子对接的主要的软件安装方法,其中vina程序是应用命令提示符打开的,但是有些电脑却不能正确打开,很可能是环境变量的设置问题。以下介...
前两节已经对分子对接过程中,蛋白和小分子的基本的准备工作进行了介绍。相信大家应该很容易掌握到其中的操作内容,一旦受体和配体分子准备完毕之后,下一...
上节讲到如何从PDB网站下载需要的蛋白,对其和原位配体进行准备之后;下一步就是准备你所需要和蛋白对接的小分子化合物,该步骤方式有很多,这里介绍一...
1 PDB网站(https://www.rcsb.org/)下载需要蛋白结构; 2 以PDB ID 2QMJ 人体葡萄糖淀粉酶为例,查看蛋白名称...