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2020-10-20 校正单细胞数据的批次效应及原理
推荐一篇博文:https://towardsdatascience.com/how-to-batch-correct-single-cell-7...
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2020-10-01 jupyter lab 报 kernel error错误的解决办法描述： 进入jupyter-lab后提示kernel不存在，同时自己想要选择的kernel没有 原因： "scenic protocol"这个环...
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2020-09-29 使用Alevin实现【输入】fastq→【输出】umi count matrix首先要知道alevin属于salmon的一个工具，用于定量单细胞转录本，使用的比对方式是类似于kallisto的pseudo align，即不将...
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2020-08-29 单细胞注释用到的基因标志物传统的方法是无监督聚类+群标志物分类；或者根据已有单细胞数据集作为参考CellAssign工具提出了一种根据已知gene marker set+...
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2020-08-28 SingleR v1.2.4单细胞自动注释软件首先SingleR属于不基于Prior Knowledge的注释方法；相对应的还有基于Prior Knowledge的方法，比如CellAssi...
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2020-08-25 r7000 2020 4800H配置Ubuntu20.04路径
安装过程参考：https://www.bilibili.com/video/BV11k4y1k7Li?from=search&seid=4172...
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2020-08-19 发表在Cell的单细胞文章如何预处理10X和SmartSeq2数据方法部分还是很有参考价值的 测序至获取细胞 10X测序技术 比对至GRCH38 R包dropletUtils的 函数将真实的细胞同背景RNA表达...
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2020-07-16 解决samtools报错：error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0
今天想使用samtools时突然报错： samtools: error while loading shared libraries: libc...
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2020-07-14 通过简单的内联重定向和变量调用实现gatk json文件的批量生成
直接上代码： 使用内联重定向符号<<和首尾标记，可以将多行文本写入json文件首尾标记可以是任意选择，我这里用EOF(像haha，hehe等也是...