有一个师兄告诉我,bowtie2比对长度相对bwa mem是要更长的,所以某种程度上来说bowtie2是比mem更严格一种比对方法。不知是不是有道理的。
WGS分析笔记(2)—— bwa vs bowtie2更新于2020.10.29 在进行正式的mapping记录之前,先记录一下bwa与bowtie2在mapping这个环节的情况。 一般对于WGS结果的mapping,一般推荐...
有一个师兄告诉我,bowtie2比对长度相对bwa mem是要更长的,所以某种程度上来说bowtie2是比mem更严格一种比对方法。不知是不是有道理的。
WGS分析笔记(2)—— bwa vs bowtie2更新于2020.10.29 在进行正式的mapping记录之前,先记录一下bwa与bowtie2在mapping这个环节的情况。 一般对于WGS结果的mapping,一般推荐...
请问您有对注释后的genbank按序列顺序排序吗?是怎么解决的?谢谢
叶绿体基因组注释软件PGA使用说明PGA-Plastid Genome Annotator[https://github.com/quxiaojian/PGA] Qu X-J, Moore MJ, Li D-...
老师好。我使用了该软件进行注释,但是我发现注释获得的genbank文件中的顺序是按照基因名进行排序的,而不是按序列进行注释的。
请问有某种工具来排序一下吗?
叶绿体基因组注释软件PGA使用说明PGA-Plastid Genome Annotator[https://github.com/quxiaojian/PGA] Qu X-J, Moore MJ, Li D-...
你好,请问得到的.coord有没有直接可视化的方法,比如我想做circos圈图。
应该是最新最详细的MUMmer中文使用说明如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候,大家得到的序列都是单个基因的长度,所以一般都是逐个基因的比较,用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方...
最近在看泛基因组学,学习了下MUMMER软件(http://mummer.sourceforge.net/manual/):适用于两个全基因组(基因草图or完整基因组)的快速...
正在学习这个,请问你有没有更详细的教程推荐给我呢?谢谢你!
MUMMER 两个基因组间比较最近在看泛基因组学,学习了下MUMMER软件(http://mummer.sourceforge.net/manual/):适用于两个全基因组(基因草图or完整基因组)的快速...
网速慢的原因找到了 R 与 BioMart 数据库的语言接口 (interface) Durinck S, Spellman P, Birney E, Huber W (20...
说真的,我在大街上遇到老人家摔倒了,没有监控,或者足够证据支持我的情况下,我真的不敢去扶人,我受不了被冤枉,还要被网络暴力的伤害。
永远不知道感恩和冤枉谁先来。
北京朝阳这起车祸,让我看到人性最大的恶1. 先说一起骇人听闻的事故。 7月16日3时,北京朝阳区,一辆路虎越野车,追尾了一辆铲车。 越野车冒起滚滚白烟,有燃烧的迹象。 由于越野车卡在铲车下面,车身损坏,越野车车门...
每个女人怀孕的时候,无论平时看着多么强悍,内心多么狂野,再有了宝宝之后,都会存有一丝柔情,随着胎儿的长大,女性的身体也会随着变化,身体发胖、胸部发育,骨盆变宽等等。 十月怀胎...
最近正好在学习这几个方面,收藏了。
基因家族分析全套软件基因家族生物信息学分析 (1)基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通过基因复制进行物种特异性扩增,主要有染色体片段复制、串联复制和反转录子转座等三种形式,可能导致功能丢...
@Navi丶S1mple 感谢!我在2.7下进行,顺利运行了,非常感谢。因为我是使用老师给的指导文件,可能有些内容过时了。再次感谢!
其实MCScan画图也可以很好看最近发现了python版的MCScan,是个大宝藏。由于走了不少弯路,终于画出美图,赶紧记录下来 github地址 https://github.com/tanghaibao...