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    宏基因组shotgun入门笔记

    目录 背景知识1.1. 根据分析对象的分类1.2. 三个基本数据处理问题1.3. 一般分析流程1.4. 比较宏基因组学的应用1.5. 目前存在的技术问题实验设计2.1. 几点...

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    Mafft Trimal Fasttree建树

    导读 barrnap预测细菌基因组16S,获取结果文件第二行最长16S,保留>1400bp的16S。mafft做序列对齐。trimal修剪序列。fasttree建树。ggtr...

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    生信常用文件格式

    2021.6.6 1. 序列格式 1.1 fasta 简介一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来表示,且允许在序列前添加...

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    【生信】R语言id转换两种方法(附代码)

    代码都是直接给出来了需要修改的地方我进行了标记只要修改一下都能直接用 方法一:下载平台数据以得到对应信息 首先进入官网https://www.ncbi.nlm.nih.gov...