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  • 学长,我有个疑问想请教一下,yahs.out.bin这个文件生成为空,于是juicer pre那一步我用aligned.bam替代bin文件,但是最后out_JBAT.txt的文件也是空的,这是什么原因呀

    什么年代了,还在用传统的3D-DNA?

    之前使用的是3D-DNA流程做Hi-C的辅助组装,它的最大优势就是输出结果可以对接下游的JBAT(juicerbox with Assembly Tools)进行手动矫正。然...

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    群体遗传学与重测序分析

    分子层面对生物的研究,在个体水平上主要是看单个基因的变化以及全转录本的变化(RNA-seq);在对个体的研究的基础上,开始了群体水平的研究。如果说常规的遗传学主要的研究对象是...

  • 全长转录组分析

    sample1 sample1基本测序信息统计 画频数分布直方图 获取一致性序列CCS 统计CCS信息 画频数分布直方图 CCS分类 isoseq3 refine(去除plo...

  • 您好,请问run_gcdep.R这个脚本能看一下吗?

    FG12组装注释全过程

    测序: RNA-seq:100Xnanopore:80Xresequence:30X 质控: 使用fastp对RNAseq和Resequence测序数据进行质控Reseque...

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    使用JBrowser配置参考基因组和基因注释信息

    准备参考基因组hg19及其基因的注释文件 使用JBrowser自带的脚本导入参考基因组序列 导入参考基因组后,会在当前文件夹中生成一个seq文件夹和trackList.jso...