使用Snakemake搭建分析流程 目前已有的框架 A review of bioinformatics pipeline framework 的作者对已有的工具进行很好的分...
scRNA-seq数据分析想必大家都比较熟悉了,自2014年nature biotechnology提出单细胞拟时分析或称为轨迹分析(Trajectory)已经有五个年头了。...
比对软件很多,首先大家去收集一下,因为我们是带大家入门,请统一用hisat2(官网https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...
原文转自:RNA-seq:TopHat2+Cufflinks分析流程 (2015-06-09 17:21:42) 1、测序数据质量控制:fastqc软件 1)使用方法:/li...
1、加载需要的包 2、导入数据 我这里的数据其实就是一列基因名,是通过其它分析挑选出来的几百个基因,想要看看这些基因是否能够富集到某些特殊的通路3、ID转化做GO分析是不能直...
Bioconda 安装详细指南 转自:生信技能树-转录组作业(一)来自零基础的小白 这位老兄确实写的狠详细!忍不住转了,win用户还是看原贴把,我把vm装ubuntu那块删了...
一听到linux操作系统,大多数人都望而生畏,其实没有那么恐怖的,下面这些命令就用来装X吧haha~ cd-----切换文件目录 cd 切换到当前用户的主目录 cd ...