使用Snakemake搭建分析流程 目前已有的框架 A review of bioinformatics pipeline framework 的作者对已有的工具进行很好的分...
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snakemake--我最喜欢的流程管理工具 -
STREAM:一款scRNA-seq拟时分析工具scRNA-seq数据分析想必大家都比较熟悉了，自2014年nature biotechnology提出单细胞拟时分析或称为轨迹分析（Trajectory）已经有五个年头了。...
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RNA-seq(5):序列比对：Hisat2比对软件很多，首先大家去收集一下，因为我们是带大家入门，请统一用hisat2(官网https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...
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RNA-seq :TopHat2 + Cufflinks分析流程(2018-05-28)
原文转自：RNA-seq:TopHat2+Cufflinks分析流程 (2015-06-09 17:21:42) 1、测序数据质量控制：fastqc软件 1）使用方法：/li...
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clusterProfiler包做GO分析1、加载需要的包 2、导入数据 我这里的数据其实就是一列基因名，是通过其它分析挑选出来的几百个基因，想要看看这些基因是否能够富集到某些特殊的通路3、ID转化做GO分析是不能直...
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Bioconda 安装转录组分析工具详细指南
Bioconda 安装详细指南 转自：生信技能树-转录组作业（一）来自零基础的小白 这位老兄确实写的狠详细！忍不住转了，win用户还是看原贴把，我把vm装ubuntu那块删了...
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简单易懂的Linux常用操作命令（一）一听到linux操作系统，大多数人都望而生畏，其实没有那么恐怖的，下面这些命令就用来装X吧haha～ cd-----切换文件目录 cd 切换到当前用户的主目录 cd ...
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10X单细胞测序分析软件:Cell ranger单细胞测序有着漫长的过去，却只有短暂的历史---谁说的！ 说她漫长是因为到如今也有十几年的历史了，说她段短暂是因为针对单细胞的分析工具越来越有意义开发周期却越来越短。一般生物...
