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基因表达相关性也可以用弦图可视化（R语言）表达谱分析中，经常会使用到相关性分析，探索一组基因间的共表达特征。例如，这些基因间的表达是否存在较强的协同性，一个基因表达值的改变是否与另一个基因表达值改变显著相关，它们之间...
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香港某大学在读phd，记录一些学习生信过程中笔记
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相关性分析的图形在R中绘制
相关性分析的图形绘制 相关性分析在我们做生信过程中用到的频率很高。往往在别人的文章里看到这样的图。在自己找到hub基因中，进行相关性分析去看基因和基因的表达量之间是否有相关性...
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推荐一个画连锁不平衡图（LD block）的软件LDBlockShow，亲测比haploview好用！
最近需要画LD block,之前一直用haploview软件画，haploview软件毛病比较多，比如不能有多态位点，输入的变异位点不能太多等。动不动就报错。 最近试了一下另...
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SNP x SNP 上位效应（epistasis）分析
传统的全基因组关联分析（GWAS）计算的是单个SNP与表型的相关性，除此之外，我们还可以进行SNP之间的互作效应与表型的相关性分析。 本推文主要介绍的是SNP间的上位效应与表...
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Logistic回归分析之二元Logistic回归在研究X对于Y的影响时，如果Y为定量数据，那么使用多元线性回归分析（SPSSAU通用方法里面的线性回归）；如果Y为定类数据，那么使用Logistic回归分析。 结合实际情况，...
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Primer Premier 5.0引物设计PCR引物设计⑴ 确定PCR产物片段大小（product length）；⑵ 确定引物所在区段；⑶ 确定引物序列的长度范围（primer length ）；⑷ 确定引物Tm值...
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用NCBI查找已公布的引物序列，3秒钟就能带你完美找到~ZSCI 1.mRNA引物序列查找 2.lncRNA引物序列查找 注意：用此方法只建议进行 mRNA和lncRNA的基因表达引物查找。 一、mRNA引物序列查找 步骤都在图上...
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科研干货丨手把手教你做PCR引物设计！在整个PCR体系中，引物占有十分重要的地位。PCR的特异性要求引物与靶DNA特异结合，不与其他非目的的DNA结合，PCR的灵敏性要求DNA聚合酶能与引物进行有效的延伸，可见引...
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2020-12-06 引物设计--小结
引物设计原则 一、Tm值 sense primer和anti-senseprimerTm温差最好不超过2度。 二、GC% GC含量 对于PCR反应来说GC含量在40%—60%...
