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另外你这个enrichKEGG需要指定物种,你没指定。
R语言跑kegg报错,这是为什么呢运行后一直出现这个Reading KEGG annotation online: fail to download KEGG data... Error in downloa...
原文章链接https://www.jianshu.com/p/635031d8ee76
R语言跑kegg报错,这是为什么呢运行后一直出现这个Reading KEGG annotation online: fail to download KEGG data... Error in downloa...
我前两天也遇到这个问题了,后来查到帖子才知道是KEGG的协议问题,运行以下代码即可。
install.packages(“R.utils”)
library(R.utils)
R.utils::setOption(“clusterProfiler.download.method”,“auto”)
R语言跑kegg报错,这是为什么呢运行后一直出现这个Reading KEGG annotation online: fail to download KEGG data... Error in downloa...
R.utils::setOption("clusterProfiler.download.method",'auto')
这行代码也能解决问题。
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