动植物基因组组装（华中农已毕业的生物狗）的分析小经验，不定时记录日常搬砖踩坑记录，欢迎互相交流学习~<br>学无止境，温故而知新~
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@静默浩然 谢谢
如何使用snpEff创建本地数据库
snpEff的使用是在Linux系统中Java运行环境下。 一、下载snpEff 方法一： 直接在家目录下载使用命令 wgethttp://sourceforge.net/p...
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重测序，群体遗传入门ing
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建立数据库后，我的数据库目录下没有产生一个".bin"文件，但是grep -i 后可以看到自己建立的数据连接。这算是成功建立数据库了吗？但是注册vcf文件时，却显示 ERROR while connecting to http://downloads.sourceforge.net/project/snpeff/databases/v4_3/snpEff_v4_3_IRGSP-1.0.zip
java.lang.RuntimeException: java.lang.RuntimeException: File not found on the server. Make sure the database name is correct.
请问这是为什么呢？如何使用snpEff创建本地数据库
snpEff的使用是在Linux系统中Java运行环境下。 一、下载snpEff 方法一： 直接在家目录下载使用命令 wgethttp://sourceforge.net/p...
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群体遗传笔记（一）：群体间选择信号的检测及GO注释从获取下机数据做质控、比对，到calling snp获得vcf文件这一步，网上已经有非常详细的教程，有GATK4.0和全基因组数据分析实践（上），还有Samtools+bcf...
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