简要内容--拟时序分析的定义--结果解读--------做出结果(cluster、state)--------确定起始点--------做start····end的图(并且映...
想获取更多,请至公众号-KS科研分享与服务- 其实之前我们细胞的分群是很粗糙的,只是一个大概的方向,随着深入的研究,需要对特定细胞的更多亚群进行分析,这里我们选择免疫细胞进行...
本文涉及:亚群合并,亚群提取,亚群细分,亚群抽样 一般来讲,不同亚群的细胞具有不同的功能,因此亚群分析对于研究十分重要,会影响后续分析结果。 进行细胞亚群的分群的依据: 细胞...
在发育过程中,细胞会对刺激做出反应,在整个生命过程中,从一种功能性“状态”转变为另一种功能性“状态”。拟时序分析(pseudo-time),它指通过构建细胞间的变化轨迹来重塑...
3. CellChat CellChat,用于根据单细胞数据对细胞间通信进行推理、分析和可视化。包含文献支持的多个物种中的配体-受体相互作用,从而全面概括已知的分子相互作用机...
大家好呀!今天为大家解读的是一篇于2021年1月17日发表于nature communications的文章,题目为Inference and analysis of cel...
(1). 单细胞上游软件cellranger:单细胞上游软件cellranger从头说[https://www.jianshu.com/p/9a09f7ad9d93] (2)...
最近,空间转录组学研究炙手可热。细胞及其在组织样本中的相对位置之间的关系对于理解疾病病理可能至关重要。空间转录组学是一项开创性的技术,它使科学家能够测量组织样本中的所有基因活...
本期内容同步发布于单细胞天地微信公众号。 回顾——细胞通讯网络构建 前面的帖子中我们已经成功地进行了细胞间通讯网络的构建,总的来看借助下面简易的分析流程即可完成: 今天继续介...