<br>研究方向：基因组学，生物信息学<br>强行输出～～<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fblog.chipcui.top" target="_blank">https://blog.chipcui.top</a><br>
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2022《Nature Plants》通过基因组组装揭示模式蕨类植物的动态基因组进化Introduction 大多数蕨类植物的大基因组和复杂度，阻碍了其通过基因组组装来阐明蕨类生物学和陆地植物的进化。本研究对水蕨（Ceratopteris richardii...
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表达矩阵的归一化和标准化，去除极端值，异常值表达矩阵的归一化和标准化，去除极端值，异常值 今天在学习转录组知识，在进行做表达量热图时候发现表达量差值很大，于是上网查资料看到关于解决问题的方法，就赶紧转存记下了。 在数据...
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HMMER3.1使用最近在探索全基因组基因家族的分析方法，而找到某一家族需要通过保守结构域来预测，从而找到物种的某一基因家族，从而进行之后的分析。这里就需要用到HMMER3.1软件，鉴定物种某一...
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「IGV-GSAme」基因结构注释信息-人工矫正-神器IGV-Gene Structure Annotation Manual Editor，简称IGV-GSAme 写在前面 igv是目前最常用的本地基因组浏览器，与其开发的目标...
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用ClustalW进行多序列比对，IQ-tree构建进化树一、ClustalW进行多序列比对 ClustalW是一种渐进的比对方法，先将多个序列两两比对构建距离矩阵，反映序列之间两两关系。然后根据距离矩阵计算产生的系统进化树，对关系...
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在线和本地两种方法构建 RAxML 进化树方法和解读1：在线构建RAxML树 1. CIPRES网站： CIPRES Science Gateway V3.3[http://www.phylo.org/index.php/po...
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使用HMM进行基因家族鉴定？无人不能。写在前面 很久很久以前，各种原因，我写过一个帖子，《零基础-完全重现某个基因家族分析文章（的分析部分）》 https://www.jianshu.com/p/88075f6c...
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TBtools:基因家族分析简单流程写在前面：非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具。作者（CJchen-0410）在B站上有新手教程，大家可以给大神点个关注。 本文以《Genome-wide iden...
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基因家族分析——TBtools本次笔记分享主要参照 Y大宽和生信札记 的推文以及自己实际用过过程中的一些心得编写！ 一、大致思路 也可以参见：基因家族分析[https://www.jianshu.com/...
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MEGA | 多序列比对功能1：序列编辑 首先，要讲一条使用mega打开序列文件的技巧:直接将要分析的文件拖到mega软件的图标上，然后就是下面这个界面了。 在第一列选中序列名称，就可以对序列名称进...
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clstalX多序列比对及输出美化
Clustalx下载地址：http://www.downza.cn/soft/271001.html GeneDoc下载地址：https://github.com/karln...
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IGV-GSAman | 多少人梦寐以求的tools?写在前面 Emmm，估摸着也有一个来星期没更新。TBtools？也没怎么更新。总的来说，就一个情况：太忙，没时间。但是想来想去，国庆长假还是要做一点平时想做，却又没时间做的事...
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基因家族的鉴定-基于windows系统上的本地blast基因家族的鉴定-基于windows系统上的本地blast 基因组的序列提取，详情请看我之前的教程https://www.jianshu.com/p/211a262aebc4[...
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睡莲基因组与开花植物的早期进化今天分享一篇文献，来自去年12月张亮生团队发表在nature上的一篇文章：The water lily genome and the early evolution of f...
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基因家族分析（1）——基因家族成员的确定②
更多内容关注微信公众号：“今日之森” 后获取。 直奔主题 基因家族分析（1）——基因家族成员的确定①简单介绍了一下分析策略和数据下载。 今天就随便找一篇文章，通过实践操作来快...
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高颜值生物信息在线绘图工具
http://mp.weixin.qq.com/s/pTHHqxuf0y1MCCCBaZjt9A 十一之前，出了一期画图专辑：好色之旅-画图三字经简洁明快地总结了生信宝典推出...
