Illumina是常见的3大制造商之一，lumi包主要针对Illumina公司出品的bead系列表达谱和甲基化芯片进行质控、标准化，获得表达矩阵。它已经封装好lumiExpr...
发简信
IP属地：河南
-
R|illumina芯片beads系列-lumi -
热图复现-2022.12.3原图 复现结果 代码 重点： 对图例各参数的调整 image.png，其中需要注意的是，当图例是连续变量时，修改宽度用grid_width=unit(0.3,'cm'),修改...
-
棒棒糖图复现效果 原图 配色懒得改了，随便选的几个配色。复习了一下ggplot2画图语法，好久没画图，都忘完了！！！学习了一下geom_rect()函数和geom_abline()函数的...
-
微卫星不稳定性（MSI）、错配修复（MMR）和肿瘤突变负荷（TMB）概念及关系记录
胚系突变（Germline Mutation）是指在人的胚胎发育期已经携带的变异（几乎全部遗传自父母），存在于生殖细胞内具有遗传性，构成人与人的遗传多样性。 人体的所有细胞均...
-
biomarker与gene signature
gene signature 基因签名（特征）或基因表达签名（特征）是细胞中由于（改变或尚未改变的）生物过程或致病的医学条件而产生的具有独特特征的基因表达模式的单一或组合基因...
-
pdftools——提取PDF文本内容
因工作需要，希望快速提取pdf中的文本内容，但是又不想用pdf转换工具（容易乱码），因此搜索了R语言有没有能够实现PDF文本提取的包，发现了pdftools包用来提取pdf指...
-
简单小需求：如何将FPKM转换成TPM？
刘小泽写于19.2.21或许这还是个比较常用的需求 我们做转录组分析，得到的结果可能是FPKM。但是FPKM确实存在不准确性，推荐使用TPM。 read count和FPKM...
