在经历了第一次做·RNA-seq的摸爬滚打之后，我大概对RNA-seq的流程和要使用的软件有了一些了解，并知道了它们的用法，于是便做了第二次的RNA-seq，然后想做一个总结...
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第二次RNA-seq实战总结（1）软件的准备
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可以说一下文章吗 我也想看看
对转录组测序数据进行分析以及注释
随着二代测序技术的高速发展，人们获得了大量的转录组数据序列如何从数据中挖掘具有生物意义的信息已经成为很多研究的关键，对未知基因的功能进行预测和注释就是一个重要问题这篇文章主要...
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四川大学生物信息学2020级硕士研究生
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分享一段基因组测序数据比对和变异检测的“代码”
整个流程需要软件：bwa+picard+gatk+annovar软件的安装与使用大家可以自行百度。。。。代码如下： 代码仅供参考请铭记马克思主义活的灵魂：具体问题具体分析！！！
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对转录组测序数据进行分析以及注释
随着二代测序技术的高速发展，人们获得了大量的转录组数据序列如何从数据中挖掘具有生物意义的信息已经成为很多研究的关键，对未知基因的功能进行预测和注释就是一个重要问题这篇文章主要...
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日常搬砖
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利用三代转录本升级基因组注释（gff3）因为课题需要，我们在前期组装了一个基因组并进行了注释，但是存在两个问题，一个是没有考虑可变剪切，另一个是注释的基因并不准确，三代转录组的广泛普及对于基因研究提供了很大的便利，...
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纯二代测序从头组装基因组基因组组装 基因组组装一般分为三个层次，contig, scaffold和chromosomes. contig表示从大规模测序得到的短读(reads)中找到的一致性序列。组...
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RNA-seq 详细教程：count 数据探索（4）
学习目标 了解 RNA-seq count 数据的特征 比较 count 数据的不同数学模型 确定最适合 RNA-seq count 数据的模型 了解设置生物学重复对于鉴定样...
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FastQC数据质控报告的详细解读
Basic Statistics 基本信息 Encoding: 测序平台编号，现在Sanger/ Illumina 1.8以上都是Phred 33编码 Total sequ...
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这个怎么装呀
三代变异检测操作说明-DeepVariant
作者：Charon审稿：童蒙编辑：amethyst 众所周知，三代测序的单碱基测序错误率远远高于二代测序，PB的单碱基错误率有10-15%，而ONT也有5-20%[1]，那么...
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三代变异检测操作说明-DeepVariant
作者：Charon审稿：童蒙编辑：amethyst 众所周知，三代测序的单碱基测序错误率远远高于二代测序，PB的单碱基错误率有10-15%，而ONT也有5-20%[1]，那么...
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Linux Shell：Shell循环语句
摘要：Linux，Shell Shell中常用循环有for，while Shell循环语法结构 （1）for循环语句 for循环只能用于固定次数的循环，因此不能无限循环和用于...
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大佬请问 我用他get orf 了 结果怎么批量导出呀
「TBtools」与「用户」让所有人掌握基因差异表达分析，共表达网络分析，相关系数分析...
写在前面 前述，写了一个推文，大体是《即日起「TBtools」关闭「高速插件商店」，让往事随风~》。简单来说，舍去了两个辅助插件安装的插件，因为时代已经不需要他们。我们选择了...
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Pacbio 三代全长转录组IsoSeq3数据分析pacbio三代全长转录组数据分析isoseq31 参考官方文档及其他教程，包括原理、流程等 2 软件安装主要参考pbbiocondapbbioconda提示需要安装pyth...
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基因家族分析（5）绘制基因结构图本节介绍一款在线绘制基因结构的工具Gene Structure Dispaly Server（GSDS），简单好用功能强大。将基因家族成员 gff3 文件单独提取出来，运用它...
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你要的单细胞全长转录本建库方案：smart-seq3来了
作者：尧小飞审稿：童蒙编辑：amethyst 01 背景介绍 目前在NGS的科技服务市场上单细胞转录组和三代是最火的两个方向，也是由于工业技术升级带来的研究的新方向和新视野（...
