网上有一些很详细的教程，我这里只记录要点，其余部分按以下教程步骤来就行。 1. PicGo安装 国内下载可能较慢，取决于你的网速。下载安装好后，需要安装nodejs[http...
发简信
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PicGo + Gitee +Typora实现markdown图床 -
蛋白质三维结构预测、结果解读与评分蛋白质三维结构预测，只要有目的基因的氨基酸序列就可以做，不限物种，没有太多要求，可为文章增色。windows版本的VMD软件可在公众号生信星球回复“VMD”获得，且附带软件中...
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努力努力再努力~<br>个人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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群落堆叠柱状图+冲击图绘制群落堆叠柱状图示例文件1.某一分类级别丰度文件： 2.分组文件： OK，接下来开始绘制： 1.准备一下颜色信息 因为属或种水平物种比较多，可以多准备一些 准备作图文件 普通柱...
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利用PfamScan寻找同源基因家族
Pfam是一个蛋白家族数据库，其中Pfam-A是手工确定的高质量的蛋白家族，Pfam-B是自动注释的，是对A的补充。目前已更新到32.0，下载地址为ftp://ftp.ebi...
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谢谢分享。免费版有流量限制吗
内网穿透，将内网地址映射为外网地址
最近由于项目需要，测试微信支付回调，但是微信回调只能访问到外网地址，自己电脑上的内网地址访问不到，所以需要将内网地址映射为外网地址，这样外网就能访问我的内网项目了。 在网上找...
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内网穿透，将内网地址映射为外网地址最近由于项目需要，测试微信支付回调，但是微信回调只能访问到外网地址，自己电脑上的内网地址访问不到，所以需要将内网地址映射为外网地址，这样外网就能访问我的内网项目了。 在网上找...
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eggNOG 对基因组进行GO注释
简要介绍利用eggNOG进行在线注释GO 其原理将query序列与eggNOG编号的蛋白进行多序列比对，确定保守位点，分析其进化关系。 每个eggNOG编号的蛋白为一类蛋白。...
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正需要这个，找保守序列感觉好难。蛋白的氨基酸序列跟二级结构不知道有没有对应关系
通过多序列比对找到保守区域
序列标识图 sequencelogo 工具使用 使用在线的工具，WebLogo3 字母大小都是根据上方的运算求得的，通常来说出现次数多的字母，体积也就越大，而如果某一列只有一...
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通过多序列比对找到保守区域序列标识图 sequencelogo 工具使用 使用在线的工具，WebLogo3 字母大小都是根据上方的运算求得的，通常来说出现次数多的字母，体积也就越大，而如果某一列只有一...
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全自动分析工具 | 原核生物（基因家族）蛋白功能及进化分析写在前面 Emmm，无意间看到的一个工具。从某种意义上来说，类似真核生物中的基因家族分析自动化工具。当然，差别还是有不少的。虽然我几乎不做原核生物相关课题，不过这个工具相信对...
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Curtis Huttenhower：进化树分析发现新型R.gnavus进化支富集于IBD患者肠道内导读 IBD（炎症性肠病）是一种慢性胃肠道炎症，该疾病可能是宿主对肠道微生物的免疫应答导致的。IBD和活性氧和活性氮的产生增加有关系。而活性氧和活性氮能引起宿主细胞和肠道微生...
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加油，期待完整版
基因功能注释
1.InterPro注释 InterPro数据库简介 Interpro是EBI开发的一个整合的蛋白家族功能注释数据库，包括Gene3D、CDD、Pfam等10几个数据库，官网...
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一行命令完成RNAseq差异分析+火山图+散点图今天来给大家分享的是：怎么一行命令完成RNAseq数据差异分析+火山图+散点图。 一、准备3个文件： 1、基因表达count文件：gene_count_edger.txt 格...
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无监督一致性聚类Consensus Clustering(一致性聚类)，无监督聚类方法，可根据不同组学数据集将样本区分成几个亚型，从而发现新的疾病亚型或者对不同亚型进行比较分析。 Conse...
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拿到基因表达矩阵之后的那点事(四)得到了差异基因并进行了一顿操作可视化后，我们可以开始富集分析了，Don't say so much，要富集当然首推Y叔的成功之作-- Clusterprofiler, 因为我...
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可以从fasta中提取基因序列的4款软件
前言 做生分析有时候需要从基因组fasta文件中提取基因的序列，对于这个需求有不少现成的软件可以来实现，今天来跟大家分享4款可以完成这个需求的软件，废话不多说了，直接来看...
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@Peng_001 谢谢。刚刚接触16S扩增子分析。对全基因组的分析还不太懂。
全基因组分析实践（参考：碱基矿工）
参考：碱基矿工从零开始完整学习全基因组测序数据分析：第4节 构建WGS主流程GATK4.0和全基因组数据分析实践（上） 前言 由于人类基因组数据过大（我的小小服务器也只有50...
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