在之前的学习和练习里，比对这一步我使用过bowtie2（DNA比对）和hisat2（RNA-seq比对），现在学习另一个很火的软件：STAR。STAR能够发现非典型拼接和嵌合...
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比对软件STAR的使用
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第4章 读取微阵列数据4.1 本章范围 本章涵盖除Affymetrix以外的大多数微阵列类型。从Affymetrix GeneChips读取数据，请使用affy，gcrma或aroma.affym...
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生物数据格式 - wig
格式 当我们把测序reads比对到参考基因组后，能够得到sam/bam文件。bam/bed格式的文件主要是储存了reads到底比对到参考基因组的区域信息，而wig、bigWi...
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R语言挖掘GEO数据库实战之-GEO数据库的构成及网页点击下载基于web工具，用户可以对GEO存储的大量数据进行浏览，查询和可视化。通过四种编号GPL，GDS，GSE和GSM可以获得完整的平台，数据集，系列以及样本的信息. 其中属于用户...
