背景篇 在植物基因组中,I类转座因子,LTR-RT(LTR retrotransposons)是基因组扩张的主要原因。完整的LTR长度在85~5000 bp之间,下图图A表示...
RepeatMasker是重复序列检测的常用工具,通过与参考数据库的相似性比对来准确识别或屏蔽基因组中的重复序列,属于同源预测注释的方式。下文除了RepeatMasker的使...
在基因组注释中第一步就是重复序列的屏蔽,目前常用的从头注释pipeline就是RepeatModeler + RepeatMasker。 1. 软件安装 RepeatMask...
最近,假期在家也是很闲,没带电脑回家,起初还是爽的,爽着爽着不让回学校了,妈蛋。。浏览闲逛之时,开始败家之旅,物色轻薄本,最终没能耐住小新Pro13诱惑,PDD火速上车,这叫...
1.genome survey 数据过滤去除测序原始数据中可能包含低质量、接头污染以及含 N 过高的 reads NT比对通过BLAST对下机数据过滤后的有效数据进行 NT ...
概念回顾 Fst:群体间遗传分化指数,是种群分化和遗传距离的一种衡量方法,分化指数越大,差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。 用于衡量种群分化程度,取值从0到1,为0则认为...
一元二次函数的计算 希望通过简单的程序计算 x2 + 3x +2 = 0函数的两个解。通过终端读取1, 3, 2参数,根据求根公式计算,具体的程序如下: 通过Linux终端进...
scanf()函数是格式化读入屏幕的数据,该函数包含在头文件stdio.h中,一般形式为:scanf("格式控制字符串", 地址列表);其中地址列表就是使用 & 符号来提取变...
使用语言的过程实际上就是输入---处理---输出,本次主要学习标准化输出printf() 标准化输出、scanf() 标准化读入以及进一步简单的控制因素等。 printf()...
计算机的基础当然是变量在其中的应用,这样会将计算过程变的简单,也会为每个计算的单元提供指向性,每种语言都离不开变量的帮忙。 计算机存储的原理 二进制、八进制、十六进制是计算机...
C语言第一个程序 hello world.c 长久以来的学习者习惯是每当你刚接触一门语言的时候,使用程序输出 “hello world”才是王道!那么我开始用C编写我的第一个...
C语言初识与应用 C语言的起源 C语言是20世纪70年代由贝尔实验室开发并广为流传使用的编程语言。起初由于汇编语言难于调试和修改,所以大神们开始设计更加方便的语言来实现代码与...
写在前面 写下自己的文字是一种修行,有人说:这是药!不能停! 来到简书 1. 时至今日,高中毕业后就在也没能提起笔去真诚的写下一段东西。与其说这样,还不如说高中毕业后自己的语...