本次推送是文献分享29的对应内容。 Fig 1 基因组和比较基因组相关的文章中，最常放的一个图是对该物种和其他近缘物种以及外群构建系统发生树（Fig 1），用来研究物种的进化...
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生信分析29：基于单拷贝直系同源基因构建物种进化树 -
使用BRAKER2进行基因组注释(v 2.1.5版)
BRAKER2是一个基因组注释流程，能够组合GeneMark，AUGUSTUS和转录组数据。 在使用软件之前，有几点需要注意下 尽量提供高质量的基因组。目前随着三代测序价格下...
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服务器上安装RStudio-server服务器上安装RStudio-server 如果想在服务器上安装一个RStudio-server，你需要先保证自己拥有管理员权限，之后参考如何在服务器上安装最新的R安装R语言，...
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DIAMOND: 超快的蛋白序列比对软件
相见恨晚，还好遇到了它 今天用BLASTX将我的转录本序列在UniProt蛋白数据库(700w条序列)中搜索，80个线程，过了1小时大概就分析1000条吧。实在是有点慢，于是...
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水平基因转移简单介绍
基因水平转移是不同物种之间或细胞器间基因的交流。基因水平转移现象在原核生物中普遍存在, 在真核生物中近年来也发现了众多例证, 说明水平转移是生物界的普遍现象。 在已有的基因水...
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【陈巍学基因-3】small RNA-seqMicro RNA参与许多的生命调节过程，是近十年来的一个研究重点。 这次介绍：1.small RNA建库测序方法2.small RNA的生物信息学分析 表达量差异分析 聚类...
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DU7：如何对小RNA测序数据进行长度分布统计小RNA测序数据长度分布规律：1、24nt>21nt>22nt>23nt2、>60%数据在20-24nt之间 一、数据为fasta格式，首先写一个脚本统计各种长度的sRNA的...
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miRNA-seq分析流程参考0[https://cloud.tencent.com/developer/article/1054975]参考1[https://www.jianshu.com/p/8...
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bowtie2比对软件的安装及参数详解
测序数据分析软件，Bowtie是一个超快的，存储高效的短序列片段比对程序。它能够以每小时处理2500万35bp reads的速度，将短的DNA序列片段（reads）比对到人类...
