@Alisa_1855 可以分享一下代码吗？
Transcriptional noise ratio（转录噪音比例）在一篇文章中，在研究young和old 的小鼠的过程中，提到了old的样本的转录噪音增加的问题。这篇文章的名字是《An atlas of the aging lung map...
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这个香农熵应用到基因表达上能说明什么呢？
如何使用R计算香农熵？
前言 1.1948 年，香农提出了“信息熵”(shāng)； 2.信息量的度量就等于不确定性的多少。即：要搞懂一个非常非常不确定（gaoleng）的女孩（或是说我们一无所知的...
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@小王的笑 https://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Rfam/CURRENT/ 在databse里找一找
Rfam:small-RNA注释分类
Rfam是用来鉴定non-coding RNAs的数据库，常用于注释新的核酸序列或者基因组序列。 infernal说明书:http://eddylab.org/inferna...
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@软萌白甜Hedy icelogo
第8篇：用网页版工具做功能分析和motif分析
上一篇介绍了使用ChIPseeker对peaks的分布和邻近基因的注释。除此之外，下游分析通常还包括鉴定我们感兴趣的蛋白质结合的motif；鉴定这些结合区域的基因以及这些基因...
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museuploader_linux.py在哪里能下载到啊
超高速 | 使用 MuseTransfers 进行文件传输
1. 扯淡时间[#%E6%89%AF%E6%B7%A1%E6%97%B6%E9%97%B4] 在追求高效的今天，会发现数据传输时常存在不高效的状态，如下图说明：你有A、B两台...
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【已解决】Xshell评估期已过，xshell7个人免费版下载Xshell功能强大，在使用过程中，本人习惯它的黑底风格，所以一直用的Xshell，虽然好用，但很多人的xshell是在软件管家里下载的，或是不知道哪里有免费的，所以下载到了...
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跟chip的流程没什么区别吗
MeRIP-Seq流程
MeRIP-Seq流程图如下： 1 数据下载 注意事项：Aspera不能在root权限下安装，必须新增加一个普通用户才安装，一般安装在/home/user/下，安装完成后将下...
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@caokai001 完全没毛病👍
雅卡尔指数 (Jaccard index)
雅卡尔指数，或者称为交并比、雅卡尔相似系数，可以用于比较样本集的相似性与多样性。其定义为两个集合交集大小与并集大小之间的比例： 雅卡尔距离（Jaccard distance）...
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@dicklim 解决掉了 感谢
200918 Circ之旅4.2-CIRIquant
Kevinzjy/ CIRIquant[https://github.com/Kevinzjy/CIRIquant]CIRIquant-cookbook[https://ci...
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config.yml 具体要什么格式写啊 我照着他的说明书写频繁报错
200918 Circ之旅4.2-CIRIquant
Kevinzjy/ CIRIquant[https://github.com/Kevinzjy/CIRIquant]CIRIquant-cookbook[https://ci...
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合并之后 junction reads里的那些NA怎么处理啊
子宫内膜癌circRNA数据分析（重分析）
项目目的 CIRI2和CIRCexplore,2联合使用对数据进行circRNAs鉴定，并进一步做下游的差异表达等分析。 项目流程 1·tophat，BWA用于map到参考基...
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我也得到了这样一张只有一条非常浅色的线的图 看其他的正常的结果中间都挺饱满的啊 这个是由什么原因造成的啊? 分辨率的问题?
HiCPlotter
ref：https://github.com/kcakdemir/HiCPlotter py2.7 python /media/shen/*/sun/biosoft/HiCP...
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@坚持天天吃早餐 谢谢
ChIP-seq实践(H3K27Ac,enhancer的筛选和enhancer相关基因的GO分析)
在实践之前，我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点：（参考文章：https://www.jianshu.com/p/8aca72809c5c） 组蛋白修饰能预测染色质的类型（异...
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有没有什么途径能预测superenhancer呢
ChIP-seq实践(H3K27Ac,enhancer的筛选和enhancer相关基因的GO分析)
在实践之前，我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点：（参考文章：https://www.jianshu.com/p/8aca72809c5c） 组蛋白修饰能预测染色质的类型（异...
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LTR ERV的信息要在哪里找啊
「文献06」植入前胚胎的染色质可及性和转录组图谱
日期：2019年2月9日——2019-Week6分类：「思路,方法」题目：An integrated chromatin accessibility and transcri...
