没啥，日常秀操作。闲来无事组建了一个Python的QQ群：639584010.（群文件有学习手册，面试题，开发工具，PDF文档教程） 如果有想学习Python的朋友，欢迎加入讨论。
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喜欢写代码的外科医生。
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最近不常登陆简书，若评论问题没有及时回复，可以发邮件交流 bioinfortime@163.com
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北京基因组所研究生在读，实验&生信小蜗牛一只。欢迎一起讨论呀~ <br>liulinli17m@big.ac.cn
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12个ggplot2扩展包帮你实现更强大的可视化
ggplot2自从2007年推出以来，成为世界范围内下载最频繁、使用最广泛的R包之一。许多人包括ggplot2的创建人Hadley Wickham将这一成功归功于ggplot...
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@547可是贼帅的547 好的 谢谢楼主
hisat2+stringtie+deseq2分析RNA-SEQ数据
hisat2+stringtie for ((i=2064449;i<2064457;i++)); do hisat2 -p 2 --dta -x ~/RNASEQ/inde...
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@547可是贼帅的547 我之前设的就是1
现在我在考虑是设为10还是怎么搞差异基因太多了😔hisat2+stringtie+deseq2分析RNA-SEQ数据
hisat2+stringtie for ((i=2064449;i<2064457;i++)); do hisat2 -p 2 --dta -x ~/RNASEQ/inde...
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楼主请教您一个问题，我数据分析完后最后的count 平均值小于1而且差异基因8000多个，查看了下数据有的总reads说不到20但logFC却>4，这肯定是假的😂。请问这个能在过滤的时候把小于10reads的基因全去掉吗?或者您有什么好的方法可以建议下吗？
转录组入门（7）：差异表达分析
这个步骤推荐在R里面做，载入表达矩阵，然后设置好分组信息，统一用DEseq2进行差异分析，当然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。基本任务是得到差异分析结果，进...
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楼主请教您一个问题，我数据分析完后最后的count 平均值小于1而且差异基因8000多个，查看了下数据有的总reads说不到20但logFC却>4，这肯定是假的😂。请问这个能在过滤的时候把小于10reads的基因全去掉吗?或者您有什么好的方法可以建议下吗？
hisat2+stringtie+deseq2分析RNA-SEQ数据
hisat2+stringtie for ((i=2064449;i<2064457;i++)); do hisat2 -p 2 --dta -x ~/RNASEQ/inde...
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不常上线，有事可以找@547的小书童呀
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楼主请教您一个问题，我数据分析完后最后的count 平均值小于1而且差异基因8000多个，查看了下数据有的总reads说不到20但logFC却>4，这肯定是假的😂。请问这个能在过滤的时候把小于10reads的基因全去掉吗?或者您有什么好的方法可以建议下吗？
RNA-seq(7): DEseq2筛选差异表达基因并注释(bioMart)
============================================写在前面：可以参考另外一篇《得到差异基因后怎么做？[https://www.jians...
