@九叶5486 从未听说过😓
轻松绘制临床基线表Table 1Table 1是总结研究样本中变量组成及变量间关系的一张表。R语言可以通过几行代码快速生成Table 1。本期用到的是“tableone”，是我制作Table 1时最喜欢用的...
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一文理清常见的基因富集分析
前言 对于很多小伙伴来说，刚入手生信时接触最多的就是差异分析，即在基因组层面可以算突变率差异，转录组层面可以算基因表达水平差异，表观组可以观察甲基化水平差异，蛋白质组/代谢组...
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R语言编程-Tidyverse 书籍 - R MarkdownR Markdown 是Markdown在R中的延伸。除了具备一般Markdown 语法功能之外，最关键的是可以在Rmarkdown 中插入代码块，并能运行代码，将代码运行结...
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R语言入门--第十二节（Logistic与泊松回归）之前学过标准回归分析，用预测变量预测响应变量，响应变量要符合正态分布。当结果变量为二值型或者计数型可以分别用Logistic回归，泊松回归进行阐释建模；可均通过基础glm()...
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设置xlim和ylim
临床预测模型列线图的评估：校准曲线
模型构建完成后需要对模型进行评估和验证其性能。模型预测的生存率与实际的差距有多大呢？一般是看校准曲线。例：一个模型（其C指数为0.8）评估某位患者5年复发率为70%。说明该模...
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生信分析阐明肿瘤纯度对GC微环境的复杂作用，为个体化治疗方案提供新的见解Comprehensive Characterization of Tumor Purity and Its Clinical Implications in Gastric...
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基于临床数据构造机器学习模型
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跟着Science学作图：R语言ggplot2画箭头展示变量对主成分的贡献论文 https://www.science.org/doi/10.1126/science.abk0989[https://www.science.org/doi/10.1...
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跟着Plos Biology学作图：R语言ggplot2双Y轴折线图论文 Large variation in the association between seasonal antibiotic use and resistance ac...
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跟着Environmental Research学作图：R语言ggplot2堆积柱形图叠加折线图（2）论文是 Global burden of lung cancer attributable to ambient fine particulate matter pollut...
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12 - SVM, KNN，LR, RF简要介绍这里接第11篇[https://www.jianshu.com/p/d27ba9c858ff]的介绍。 5 支持向量机（Support Vector Machine, SVM...
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文献解读09 卵巢癌转移情况的SEER数据库分析Deng K, Yang C, Tan Q, et al. Sites of distant metastases and overall survival in ovari...
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KNN算法-5-KNN算法总结
KNN的优点 1、KNN算法是一个非常简单的算法，理论成熟，思想简单，既可以用来做分类也可以用来做回归 2、天然解决多分类问题，也可用于回归问题 3、和朴素贝叶斯之类的算法比...
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R语言拼图（含生存分析），R语言画布设置杀杀 发一些拼图的小技巧 拼图之前，先要根据自己图片的张数，设置好画布大小，这很重要我画图的经验中，正常一张方形的图会设置为width和height都等于5，如果两张横着拼在...
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机器学习--有监督--支持向量机SVM支持向量机Support vector machine，SVM是一种有监督的机器学习算法，可用于分类或者回归。本次笔记以分类任务为例主要学习。 1、简单理解 假设对于特征空间...
