作为表格文本处理命令awk的延伸，Heng Li开发了专门处理生物信息学的文件（例如bed, sam, vcf, gtf等）的命令bioawk，我们了解一下。 简介 bioa...
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35.《Bioinformatics Data Skills》之生物信息文本处理利器bioawk
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38.《Bioinformatics Data Skills》之命名管道与进程替换
当我们使用的程序输入与输出的是多个文件，无法使用管道命令。生物信息学的程序中这种情况实际是比较常见的，假如说程序program需要2个输入与2个输出，那么其会产生4个中间结果...
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生信 | 基因组组装实战（六）：基因组质量、一致性、保守性、LAI等评估写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.基因组组装指标评估 为什么...
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estimate 算法计算肿瘤纯度
0.肿瘤纯度[http://222.70.95.243:6893/files/ESTIMATE%E5%88%86%E6%95%B0/estimate.html#%E8%82%...
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GO富集之topGOtopGO手册中的实例实现 手册地址：http://bioconductor.uib.no/2.7/bioc/vignettes/topGO/inst/doc/topGO.p...
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RNA-Seq：差异表达分析及可视化上一篇已经系统介绍了有参RNASeq上游分析，从测序数据fastq文件到最终生成表达矩阵。这一系列基本都是RNASeq通用常规分析，其下游差异表达及可视化则根据需求及...
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基因组注释之从头预测1.创建本地BLAST数据库 使用makeblastdb程序，对上述FASTA格式的蛋白 质序列进行处理，建立本地BLAST数据库。makeblastdb -in ./uni...
