生物信息作为计算机与生物的交叉学科，最近几年也受到的大家的关注，因此关于生物信息的数据库越来越多。由于大部分主要为发文章的需求，因此部分数据库并不稳定，没人维护后部分的生物信...
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生物信息学数据库导航
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Adobe Illustrator素材-试管绘制
在生物学领域通常需要图像来形象的描述实验的过程 那么如何绘制试管呢？ 1.通过椭圆工具绘制试管口 2.通过直线段工具+弧线工具绘制试管体 3.给试管口及试管边框上色 4.绘制...
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手把手教你做GO功能富集可视化图最近有同学私聊我能不能出一期GO功能富作图并且提出要求 要非常简单 小白一看就会的那种 那么如何对这些基因进行功能富集呢？应要求必须为简单的~ 那就用在线工具富集 这里...
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生物富集分析的前世今生生物富集在生物信息中有着重要的地位，做生物信息分析的时候总会遇到这样或者那样的富集分析，比如GO富集分析等。大多数情况下我们都是使用线上在线分析解决。是否会遇到这样一种情况，...
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根据关键词和限制时间爬取微博信息今天师姐要我帮她爬微博数据... 因为师姐有时间的限制 因此我们仔细观察微博的状态 发现这里有一个高级搜索 微博还是很贴心的 居然只能爬50页？？ 我收回我刚才的话，哼~ 然...
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在RNA-seq 数据中鉴定lncRNA最近读了一篇文章名为《LncPipe: A Nextflow-based pipeline for identification and analysis of long n...
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数据科学（DS)学习笔记-stackingstacking是一种集成学习模型，主要利用分层模型搭建学习框架。以两层为例，第一层由多个基学习器组成，其输入为原始训练集，第二层的模型则是以第一层基学习器的输出作为特征加入...
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python可视化调试工具HeartrateHeartrate 是一个 Python 的工具库，可以实时可视化 Python 程序的执行过程。这个过程可以说是相当的炫酷... 如图所示，左侧数字表示每行代码被触发的次数...
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数据科学（DS)学习笔记-集成学习集成学习是机器学习中一个非常重要且热门的分支，是用多个弱分类器构成一个强分类器，其哲学思想是“三个臭皮匠赛过诸葛亮”。一般的弱分类器可以由决策树，神经网络，贝叶斯分类器，K-...
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数据科学（DS)学习笔记-决策树一. 什么是决策树 决策树(Decision Tree）是在已知各种情况发生概率的基础上，通过构成决策树来求取净现值的期望值大于等于零的概率，评价项目风险，判断其可行性的决策...
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数据科学（DS）学习笔记1站在2019年的尾巴里，我们即将迎来新的2020年，由于课程需要，我们需要利用机器学习的原理去处理我们的数据，因此在2019年的尾巴，我们将开启全新的学习之路，在这个平台记录...
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hisat2+stringtie+deseq2 RNAseq（二）测序得到的是几百bp的短read， 相当于把拼图打散了给你。如果没有参考基因组，从头组装会有很大的工作量，而且对于有参考基因组的动植物来说，不依靠参考基因组进行RNAseq ...
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hisat2+stringtie+deseq2 RNAseq（一）RNAseq 作为转录组分析中的比较经典分析方法，现在有很多的分析方法和分析思路从tophat+cufflink 到 hisat2+ballgown每个分析流程都有相应的优点...
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fastp全新的数据质控软件各位做生信的小伙伴都知道，对于下机的FASTQ数据需要进行质控和预处理，以保证下游分析输入的数据都是干净可靠的。通常我们都是使用FASTQC等软件进行质控，使用cutadap...