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  • Restricted cubic spline(RCS):限制性立方样条

    当我们的自变量和因变量之间不是简单的线性关系,我们还可以通过多项式回归,多元线性回归等方法构造非线性的关系模型,限制性立方样条(RCS)也是一种选择。 什么是Restrict...

  • 10x数据热图绘制之指定图例上下限

    错误信息 最近处理10x数据,需要把已有的亚群合并,然后绘制目标基因的热图~朴实~ 无华~ 枯燥~处理完成之后,需要调整亚群绘制顺序,基因的顺序OK~ 我改~ one mom...

  • 多线程(一)

    Python中提供了多个模块来支持多线程编程,包括thread,threading,Queue模块名等。thread提供了基本的线程和锁定支持;threading模块提供了更...

  • MetaStat原理

    一直不清楚MetaStat的脚本输入到底应该是Read数还是相对丰度,大概过了一下R语言版本的MetaStat代码的脚本,留此记录。 代码解析 R语言版本的MetaStat被...

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    CPGI130原理

    参数选择 可选的几个参数 原理解析 A. 按照LENGTH在序列的起始处初始化一个窗口,每次向后移动1bp,直至寻找到符合阈值的一个LENGTH的窗口B. 找到一个符合阈值的...

  • Python 类的一些特殊方法

    Python 类的一些特殊方法 Python 的类中存在一些特殊的方法,使得我们自己构造的类能够更加清晰并支持某些操作 Code 对象的表示形式 所谓对象的表现形式,在这里可...

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    git(一)--工作流

    为什么从这里开始 也许你对 git 的命令已经很熟悉,能够熟练的新建一个仓库,拉取、恢复、Merge你的项目,但每次用的时候依旧会有疑惑 ~ “这玩意儿到底哪里好用了?”。我...

  • Python 的 Click 模块

    简介 Click 官方文档同 argparse 模块相比,更直观,更直观,并且支持 nesting commands类似于 git 那种,除了这个特性支持的比较好,没觉得简洁...

  • Python 邮件处理

    基础概念 POP 和 IMAP 第一个用于下载邮件的协议称为邮局协议(Post Office Protocal, POP),记录在 RFC 918 中。邮局协议的目的是让用户...

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    Sublime Text 3 使用

    重装系统,从头开始配置 安装 package control 插件管理工具 The simplest method of installation is through th...

  • R语言中的%in%操作符是干什么的?

    判断前面一个向量内的元素是否在后面一个向量中,返回布尔值。 代码实例 可以使用这个语法提取向量a中的值

  • CAZy数据库

    碳水化合物活性酶数据库(CAZy) 提供了酶分子序列的家族信息,物种来源,基因序列,蛋白序列,三维结构,EC分类,相关数据库链接……建立此数据库是为了将酶分子的序列、结构、催...

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    seaborn的countplot

    说点什么呢 seaborn是python的一个可视化模块,构建于matplotlib之上,对于pandas的DataFrame这种数据结构有着很好的支持,能够大大减少构建绘图...

  • Matplotlib(3)

    获取matplotlib的配置文件的路径 对于在没有GUI的服务器,备份配置文件之后,更改其中的backend为Agg,便可以后台输出了。

  • Matplotlib(2)

    让输出更规整 之前一直有一个让我不得不避开matplotlib的原因便是它那令人蛋疼的输出。明明在Ipython Notebook中堪称完美的输出,换到了服务器端,最终输出的...

  • Matplotlib(1)

    最近被人问到一些matplotlib的问题,但对答案又一知半解,所以在这里希望加深一下对matplotlib的理解以及使用 简单的示例 这里我们使用一个简单的示例来了解mat...

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    GTF/GFF文件的差异及其相互转换

    我们在做生物分析的时候,经常会碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注释文件。他们有着相似的名字,甚至连内容都极为相似~那么,他们究竟差在哪里呢? GFF全称为general ...