你好,我添加刻度标签时,一直报错,p7+scale_x_continuous(breaks=c(0.75,1.75,2.75,3.75,4.75,5.75,6.75,7.75),labels=c(0.75,1.75,2.75,3.75,4.75,5.75,6.75,7.75)),错误: Discrete value supplied to continuous scale
跟着Nature Genetics学画图:R语言ggplot2画折线图并添加误差线折线图添加误差线是非常常用的一种可视化方法,今天的推文介绍一下使用R语言的ggplot2作图的代码。模仿的是论文 Phased diploid genome assembli...
请问,meta分析时,20篇文章的数据是分别dada2然后再合并起来?还是把所有的数据放到一起,一起进行dada2?
微生物多样性qiime2分析流程(2)使用qiime2和dada2处理16S序列我不太确定这篇文档里还有没有打错的命令,代码建议参考:一文完不成qiime2微生物多样性分析(2021版上)[https://www.jianshu.com/p/725ee7...
请问,在荟萃分析时,28篇文章的数据是分别进行Dada2然后在合并起来?还是把所有数据放到一起,直接一起进行dada2?
扩增子分析:qiime2平台全流程分析Amplicon sequencing analysis pipeline through qiime2 platform qiime2是扩增子数据分析的最佳平台之一,其提供...
你好,请问一下,荟萃分析时,20篇文章的数据是每篇文章单独进行DADA2,最后再合并?还是把20篇文章的数据全放到一起,一起进行DADA2?
Qiime2 (三)-DADA2降噪(Denoise)流程Dada 2 流程 DADA2数据处理不以序列相似度聚类,只进行去重(或相当于以100%序列相似度聚类),生成的是以ASV为单元的表格;Vsearch数据处理与Usearch...
请问vsearch对特征表进行聚类这一步,是必须得吗?
一文完不成qiime2微生物多样性分析(2021版上)之前写过一系列qiim2的教程都是零零散散的记录,里面也有不少命令打错的步骤给各位小伙伴造成了不少的疑惑,恰逢qiime2-2020.11发布,所以就在重新总结一次,这次稍后...
你好,请问批量转化的命令是什么?没咋看明白?
如何用fasq-dump解压SRA文件之前介绍了如何安装sratoolkit, 可以看我之前写的简书https://www.jianshu.com/p/188df05615c7[https://www.jians...
请问一下,如何把横纵轴转换?
使用pheatmap包绘制热图加载所需R包 设置工作路径 构建测试数据集 将热图结果按聚类后的顺序输出
你好,我是做分类预测的,请问最后的预测那个地方,如何把预测出来的结果改成预测率?比如预测出来的结果为有病,但是我现在不想要这个结果 ,需要它的预测率(就是0-1)之间的数字,,该咋做?
机器学习:05. 随机森林之RandomForestRegression填补缺失值1. RandomForestRegression 所有的参数,属性与接口,全部和随机森林分类器一致。仅有的不同就是回归树与分类树的不同,不纯度的指标,参数Criterion...
你好,请问在做随机森林分类时,最后预测那个地方,如何把预测出来的结果改成预测率?比如预测出来的结果为有病,但是我现在不想要这个结果 ,需要它的预测率(就是0-1)之间的数字,,该咋做
分类算法 - 随机森林一、定义 上次我写了决策树算法,决策树可以解决分类问题,也有CART算法可以解决回归问题,而随机森林也和决策树非常类似,采用了CART算法来生成决策树,因此既可以解决分类问题...
你好,请问分组箱线图,如何添加最大值最小值的线?加上去之后,为什么和中间的那条线不连接在一起?
ggplot2 - 箱线图(Box - plot)简介 箱线图,顾明思义,是形状像箱子并展示一组或多组数据分布的统计图,被认为是一个优于柱形图的数据可视化方案,文章中指出了很多箱线图的优点。[%20https://www.n...
你好,请问多组箱线图时,该怎么添加最大最小值的那条线?stat和geom中的width后的数值要保持一致才行,不然中间的那条线将会偏离箱体的中间,可是要保持一致的话,那最大值的那条线就太长了,所以,应该怎么弄?
个人向ggplot2箱线图总结主要从如何看图、用图与作图三个方面来对箱线图进行理解和总结。 1、看图 如图所示,箱线图是将一组数据按照大小顺序排列后进行绘制的,包含6个数据节点,分别表示出数据的上边缘、上...
你好,请问多组时,为什么stat和geom中的width参数要一致,否则线就偏离箱体,这是为什么?但要是参数一样的话,那最大值的线就长了。请问应该怎么弄?
为什么你画的ggplot2箱线图没横线 哈哈不知道大家有木有发现,基础包画箱线图是这样的: 它是一张有横线的图。而用ggplot2作图时,莫得感情,莫得横线😕。 能不能把横线加上,能啊,搜。 顺便把颜色也加上好了。 参...
你好,请问多组时,该怎么做?
ggplot箱线图之如何添加最大值最小值线(whisker-ends)ggplot作为R语言画图的瑞士军刀,相比于基础的R包,语法更加易于理解和掌握,不需要掌握很多的命令就能画出整洁美观的图表。比方说用ggplot来画箱线图,首先我们可以这样操...