linux下的shell脚本（基本） 先说明以下内容来自： http://c.biancheng.net/cpp/shell/ ，C语言中文网，请大家支持原作，点击链接查看。...
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linux下的shell脚本（基本语法） -
如何创造/处理一个segmentation fault (core dumped)
segmentation fault (core dumped)是一个曾经让我非常头疼的报错，当然它还有一种中文形式，段错误(核心已转移)。 这种错误可能会在各种程序中出现，...
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纯二代测序从头组装基因组基因组组装 基因组组装一般分为三个层次，contig, scaffold和chromosomes. contig表示从大规模测序得到的短读(reads)中找到的一致性序列。组...
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序列拼接 - Velvet
基因组测序数据的从头组装过程：测序读段（reads) > contig > scaffold > chromosome 1.核心算法 基因组测序数据的从头组装的的核心算法主要...
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测序数据质控和预处理之fastp
1. 引言 下机的FASTQ数据通常需要进行质控和预处理，以保证下游分析输的准确性。fastp软件仅扫描数据文件一次，就可以完成FASTQC + cutadapt + T...
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使用fastp进行数据质控
fastp是一款较新的数据质控软件，接触这个软件也是由于目前市场的软件各有功能但是功能都不是很全，譬如最近接触到一个RNAseq数据，质量较差，需要去除接头而且含N较多，序列...
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【生信基础】数据质控软件fastpfastp 在2018 发表于bioinformatics 具体文章地址如下：https://academic.oup.com/bioinformatics/article/...
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质控软件 fastp
注：本文全文摘选自知乎：fastp: 一款超快速全功能的FASTQ文件自动化质控+过滤+校正+预处理软件 1引言 各位做生信的小伙伴都知道，对于下机的FASTQ数据需要进行质...
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fastp全新的数据质控软件各位做生信的小伙伴都知道，对于下机的FASTQ数据需要进行质控和预处理，以保证下游分析输入的数据都是干净可靠的。通常我们都是使用FASTQC等软件进行质控，使用cutadap...
