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limma做差异分析分步运行时候没有问题, 但是把步骤写成function时一直报错 一直以为是字符串传递的问题,最后发现是因为没有指定参数更改
您好,请问Seurat的去批次是sce@data开始处理的,并不能得到去批次后的counts矩阵。我有个需求是得到去批次后的TPM矩阵,是不是需要换成MNN或者其他的去批次方法才可以?麻烦了,谢谢~
Seurat3||整合方法merge()与IntegrateData()随着单细胞测序技术的成熟,越来越多的研究者选择应用该技术来阐释手上的生物学问题。同时单细胞也不再是单样本单物种单器官的技术,往往会用到多样本整合分析的技术,这方面Seurat...
刷了机,安装好conda环境后conda又疯了。conda install -y samtools hisat2 bowtie2 bwa htseq bowtie报错开始 ...
虽然是做生物信息的,但是经常被一些基础性概念所困扰……而我又是一个强迫症,于是把这些乱七八糟的东西整理了一下,强行写了一篇小文章。东西太杂,但是彼此相关,实在想不到什么合适的...
今天介绍如下三点内容: PCA是如何计算的 如何计算每个PC所能解释的方差 特征值与PC解释方差比例的关系 1. 使用R语言自带函数prcomp计算PCA 并计算每个PC所能...
忽略矩形中的蛋白颜色,但不要忽略箭头的颜色 均手工绘制,通过查阅文献还有KEGG综合所画,错误在所难免。可留言。参考文献众多,不再一一列出。 ----------------...
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手画综合信号通路(部分)忽略矩形中的蛋白颜色,但不要忽略箭头的颜色 均手工绘制,通过查阅文献还有KEGG综合所画,错误在所难免。可留言。参考文献众多,不再一一列出。 ----------------...
http://www.bio-info-trainee.com/2041.html stringCytoscape https://www.cnblogs.com/0820L...
https://www.jianshu.com/p/07ecff240548
如果是安装rPython,则需要安装rtools和Python2.7, 将rPython压缩包解压到R library后,更改configure.win里面的python路径...
https://zhuanlan.zhihu.com/p/73487425
awk '{if($1 == "MOTIF") {$2="";print}else{print $0}}' MAST.PWM.MOTIF.1-1367 >MAST.PWM....
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http://www.360doc.com/content/18/0815/22/57890290_778579575.shtml