1. GitHub https://github.com/aertslab/SCENIC[https://github.com/aertslab/SCENIC] 2. Pap...
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SCENIC: 结果解读 -
scRNA-Seq | Seurat 包原理解析seurat 涉及的数据分析包括很多步骤。之前只顾着干活儿，也没有系统的整理过分析中的具体内容。这里就参照网上大神们分享的帖子，来梳理一下。 一、读入数据。 Read10X(...
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hdWGCNA：单细胞WGCNA分析方法WGCNA原理和分析流程[https://www.jianshu.com/p/9331eb5377d1] 单细胞WGCNA分析方法+随机森林[https://www.jian...
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细胞通讯-2单个数据集进行细胞间通讯分析单个数据集分析，多个数据集比较分析，具有较大成分差异的数据集比较分析。本教程是单个数据集分析流程 此教程概述了使用 CellChat 的单个数据集对细胞通信网络进行推断、分析...
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单细胞分析：marker鉴定（11）导读 前面我们已经确定了我们想要的簇，我们可以继续进行标记识别，这将使我们能够验证某些簇的身份并帮助推测任何未知簇的身份。 1. 学习目标 学会确定单个簇的marker 学会...
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文献(8): 单细胞和空间分析揭示FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞在结直肠癌中的相互作用
今天分享的这篇文献上个月刚发表在Nature Communications，主要内容是结合单细胞转录组和空间转录组技术，揭示了FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞的互作，及...
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TCGA泛癌TMB计算在前面系列教程中分享了如何下载TCGA表达矩阵（2022新版TCGA数据下载与整理[https://www.jianshu.com/p/98902a1bfb21])，通过R进...
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胶质母细胞瘤免疫亚型分析+免疫组化发8+分SCI今天给大家介绍一篇2022年1月发表在OncoImmunology（IF:8.110）上的一篇文章。本研究作者对单细胞转录组和bulk转录组数据集进行分析，鉴定到了一个新的G...
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基于非m6A相关新抗原编码lncRNA特征构建胶质瘤评分模型Scoring model based on the signature of non-m6A-related neoantigen-coding lncRNAs assis...
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单细胞转录组流程二：超详细！ Seurat打通单细胞常规流程Seurat standard pipeline(10核心流程) 创建Seurat对象 Read10X CreateSeuratObjecet 质控 Perc...
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关注源自免疫细胞的 snoRNA，以识别免疫领域的新生物标志物（IF10+）Identification of tumour immune infiltration-associated snoRNAs (TIIsno) for predicting...
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基于免疫和缺氧的多组学特征识别可能为LUAD患者提供更好的预后预测Multi-Omics Signatures Identification for LUAD Prognosis Prediction Model Based on the ...
