发简信
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2. ggplot2画细胞亚群的比例和条形图
2.1 按照细胞celltype分群进行绘制细胞亚群ratio的百分比图 2.2 按照细胞Celltype分群进行ratio绘制条形图 2.3 按照细胞Celltype分群进...
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1. ggpubr画vilinplot画单图 批量画图 参考文献： R语言ggpubr绘制小提琴图（violin plot） - 知乎 (zhihu.com)[https://zhuanlan.zhihu.com...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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转录组Deseq2差异分析
参考https://zhuanlan.zhihu.com/p/375756362[https://zhuanlan.zhihu.com/p/375756362]从原始coun...
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Monocle 2 中 orderCells () 报错问题解决方法
1. download monocle from https://www.bioconductor.org/packages/3.15/bioc/src/contrib/A...
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单细胞测序之图形展示1.加载数据 2.可视化 3.识别保守的细胞类型标记基因 为了筛选出跨条件保守的典型细胞类型标记基因，“FindConservedMarkers()”函数对每个数据集/组执行...
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单细胞测序之差异表达基因获得方法
1.加载数据 2.执行默认的差异表达测试 Seurat 的大部分差异表达特征可以通过“FindMarkers()”函数访问。 默认情况下，Seurat 基于非参数 Wilco...
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学习CellChat细胞间通讯分析1学习 CellChat 细胞间通讯分析 [第一部分：CellChat对象的数据输入&处理及初始化] (2022-05-22 - 简书 (jianshu.com)[https:...
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学习CellChat细胞间通讯分析2学习 CellChat 细胞间通讯分析 第一部分：CellChat对象的数据输入&处理及初始化 [Reference] (https://github.com/sqjin/C...
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TCGA——数据整理（FPKM到TPM）
0.安装包 1、下载好HTseq-FPKM的TCGA数据 2、将所有文件夹下的压缩包复制到一个文件夹下 3、解压缩到同一文件夹#gunzip()函数 4、提取藏在metada...
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