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godgmy

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东风008

基因组重复序列检测：RepeatMasker的安装及使用
RepeatMasker是重复序列检测的常用工具，通过与参考数据库的相似性比对来准确识别或屏蔽基因组中的重复序列，属于同源预测注释的方式。下文除了RepeatMasker的使...

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AntelopeBell

病毒正二十面体对称结构：病毒学常见概念 I
我对病毒学的喜爱，受先生影响。虽拜先生门下，但这些年与先生相处时间并不多。有时匆匆见一面，先生无意间提及的一个病毒学概念，我都会花不少时间去查阅资料，以加深印象。正如今天我要...

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临窗听风雨

用二代测序分析软件来跑一代的结果
2013年左右，二代测试开始崛起，不到一年大有横扫测序行业的势头。记得当时二代测序服务公司的业务员到我们实验室推销业务，宣传册十分“高大上”的样子，一问价格，内心直哆嗦。但当...

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临窗听风雨

RoseTTAFold-蛋白质预测的“平凡之路”
在个人笔记本win10自带子linux系统下，运行基于CPU运算的RoseTTAFold 避开uniref30、BFD这两个超大数据包的下载及解压提供便捷的pyRosett...

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拾柒Zzz

干货 | 全基因组CRISPR文库筛选数据分析——MAGeCKFlute
近年来，全基因组CRISPR文库筛选技术被广泛应用于肿瘤及病毒相关调控因子筛选。通过同时sgRNA文库同时敲除全基因组的不同基因，经流式或药物筛选目的细胞表型，并扩增sgRN...

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Peng_001

蛋白质的结构
蛋白质的结构总览 1）氨基酸序列2）周期性的结构构象3）整条多肽链的三维空间结构4）多个亚基形成的复合体结构蛋白质的二级结构二级结构为蛋白质经过折叠，构成的规则的片段。 ...

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冻春卷

Golden Gate，质粒改造的王者
前期文章：我们用两篇文章的篇幅大概讲了一遍质粒骨架及其各个要素的介绍：解剖式学习一个质粒结构--update[https://www.jianshu.com/p/e6c58...

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涤生生

生物信息python 入门题初级至进阶
本文水平有点low，本来不打算写这么低水平的文章，怎奈我的python水平就在这么low的水平。以此贴记录初试python解决生信简单问题的学习过程，也算让自己看清楚自己py...

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