Human cell atlas, HCA:https://data.humancellatlas.org/[https://data.humancellatlas.org/...
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属于比较常用的技巧。下面我用ggplot2内置数据集进行演示: 先来看一下,仅有散点和拟合线的图 如果想添加拟合的方程,可以使用ggpmisc包的stat_poly_eq()...
计算一组数据有没有相关性以及相关程度时,可以使用cor(),以及cor.test()计算显著性,如下所示,我们想计算这两种花的长度有没有相关性。 我们可以手动将计算的相关系数...
原文来源:Conesa A, Madrigal P, Tarazona S, et al. A survey of best practices for RNA-seq da...
前言 之前我们介绍了maSigpro的基本建模方式:分析时间序列的RNA-seq tool[https://www.jianshu.com/p/ad76dcfdf840],这...
欢迎关注公众号:oddxix 自从二代测序技术出现,把一次实验测许多条DNA序列的这个难题解决之后,一次把一个人的全基因组给测出来,最极限的情况,就是样本量就是少到一个细胞,...
1、创建虚拟变量 caret包通过model.matrix()、dummyVars()或其他方式将因子转换为虚拟变量。dummyVars()可用于从一个或多个因子变量生成一个...
Caret包(即Classification And REgression Training的缩写),包含简化复杂的回归和分类问题模型训练过程的功能。 1、导入数据并分割数据...
来源:http://topepo.github.io/caret/available-models.html 模型method 值类型依赖包调优参数AdaBoost Clas...