数据展示的时候，我们经常会用到维恩图来展示各个数据集之间的重叠（交叉）关系。R语言中有很多程序包（package）可以做这个事情，包括limma, gplots, venne...
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R语言画维恩图--VennDiagram -
【R>>DepMap】单基因肿瘤细胞表达情况CCLE是肿瘤细胞基因表达的百科全书，之前写CCLE：求任意基因的相关性[https://www.jianshu.com/p/59f979ab09ee]稍微介绍过其用法。今天...
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GEO数据挖掘之绘制PCA热图和差异基因火山图PCA和差异基因图是生信技能树[生信爆款入门课程]GEO数据挖掘的重点。为拓展课堂所学知识，现在找一个数据集对他们做下练习总结。 1.主成分PCA 图---- 2.top 1...
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UMAP的初步了解及与t-SNE的比较降维是机器学习中的可视化和理解高维数据的强大工具。t-SNE是最广泛使用的可视化技术之一，但其性能在大型数据集中会受到影响。 UMAP是McInnes等人的一项新技术。与t-...
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DAPI染色原理及使用方法
绿色荧光蛋白GFP最初是从水母中分离得到, 在蓝光波长的激发光作用下, 能发出绿色的荧光。通过载体构建,将GFP基因与目的基因融合, 表达出含GFP的融合蛋白, 可用于报告目...
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StatQuest——生物信息相关原理的入门系列(一)想学生信原理但是数学不好？不想看一串串公式也想明白各种分析的原理？StatQuest会是一个非常不错的选择！ StatQuest: 该系列视频是北卡罗来纳大学教堂山分校制作的...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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【r<-方案】TCGA barcode（样本ID）以及重名过滤我之前在简书上转载过别人写的TCGA barcode介绍，这两天碰到相关的问题，我看了看，觉得不是很清晰，再说道说道。 接触和分析过TCGA数据的朋友肯定会经常处理TCGA ...
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单细胞组学系列学习笔记
scRNA-seq数据分析 Seurat包学习笔记 Seurat包学习笔记（一）：Guided Clustering TutorialSeurat包学习笔记（二）：Integ...
