Circos是数据展示的一个极佳方式。是每一个男人都应该学会的必备技能! 如果按照我这个教程都搞不定的话,还是建议先别看别人的高阶教程了。 Circos安装及测试 首先,下载...
构建系统发育树主要有四种方法:ML、NJ、MP和BI。 与ML和NJ相比,BI的方法效率更高,已有的研究结果显示,对于同一组数据的分析,贝叶斯方法分析结果中的节点支持率高于其...
dn/ds又叫ka/ks,具体的概念,意义百度上都有。现主要介绍最近用到的三种计算途径,分别是maga7,datamonkey,paml。 做选择压力分析的序列文件,需要先c...
1.genome survey 数据过滤去除测序原始数据中可能包含低质量、接头污染以及含 N 过高的 reads NT比对通过BLAST对下机数据过滤后的有效数据进行 NT ...
基因组组装完成后,或者是完成了草图,就不可避免遇到一个问题,需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型,有三种策略: 从头注释(de novo prediction...
Google的chrome莫名其妙突然所有页面都显示“喔唷 崩溃啦”,各种插件在右下角弹出报错!这个问题我之前遇到过一次,后来通过改快捷方式的名字解决了。可是这次,隔离回来上...
比如MFannot返回的文件中的trnW(cca)是什么意思呢?W若是氨基酸一子母简称则为色氨酸,而括号里的反密码子cca对应mRNA中GGU编码的则是甘氨酸哇⊙ω⊙那这种t...
ORF(开放阅读框)最好被视为蛋白质编码区的假设。它是起始密码子和下一个终止密码子之间的DNA片段。它不是真核生物中整个蛋白质编码区的假设(由于内含子)。CDS应该是整个...
在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点,轻松实现“用别人的服务器分析自己的数据”。 基因结构绘制 1.Exon-Intron Graphic Mak...
MEGA7软件下载及安装 http://www.megasoftware.net/ 支持建树类型 数据准备 TIR.fasta 导入文件 选择Align 导入成功 选择比对方...
序列比较 认识序列 FASTA 格式,第一行是一个大于号“>”开头,后面紧接注释信息 序列相似性 相似的序列》相似的结构》相似的功能 一致度如果两个序列长度相同,那么它们的一...