写在前面 近期抽空基于OrthoVenn2给SapBase新增了一个比较基因组方面的模块。OrthoVenn2可对多物种全基因组直系同源基因簇比较和注释, 推荐安装本地版,官...
轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析(Pseudot...
1.数据标准化 (1)标准化 (2)样本总体分布 (3)样本之间的相关性 2.差异表达分析 (1)limma包分析 (2)edgeR分析 (3)DESeq2分析 3.差异结果可视化
写在前面 引物设计几乎是每个分子实验室的研究生必备的一项技能。目前,已经有许多成熟的引物设计软件供大家使用,如本地版的Primer5以及NCBI上的Primer-BLAST等...
轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 单细胞之轨迹分析-2:mono...
第七节:空间转录组分析 在本节教程中,我们将学习空间转录组的一些分析方法。10X Visium平台的空间转录组数据在许多方面是类似于scRNA-seq数据的,它包含5-20个...
前面介绍了利用Seurat对10x空间转录组数据单个样本进行数据预处理、降维、聚类分析。今天来继续分享怎么整合多个空间转录组样本,同时进行聚类和分析marker基因。跟单细胞...
旧号无故被封,小号再发一次 更多空间转录组文章: 1. 新版10X Visium 【10X空间转录组Visium】(一)Space Ranger 1.0.0(更新于20191...
写在前面 近期考研分数已经公布,9月份在各个科研领域又将注入一大波新鲜的科研血液。那么,初入茅庐的研究生新生,该如何快速并精确地掌握一个研究领域相关的知识呢?当然是通读本领域...
写在前面 刚开始整数据库的时候,用过viroBlast搭建Blast服务,详见用viroblast搭建本地blast网站 - 简书 (jianshu.com)[https:/...
@寒山梦琦 哈哈是啊
震惊!!KEGG官方工具能够完成任何物种的KEGG注释!!!写在前面 之前介绍过使用EggNOG-mapper对非模式物种快速完成KEGG注释的推文https://mp.weixin.qq.com/s/kIf6C2u3FID3ZeLt...