多啦A梦的时光机_648d

一：软件安装 二：程序运行 1.wgd mcl鉴定基因组内的同源基因 输出文件夹里面有两个文件： *.tsv: BLASTP的outfmt6输出结果*.tsv.mcl: MC...

扇子和杯子

1. 组装基因组质控 得到组装好的基因组序列之后，首先要使用多种方法评估组装质量。这里用到2款可用于基因组组装质量评估的软件——QUAST和BUSCO。 1.1 quast—...

Mr_我爱读文献

推断物种系统发育关系以及分歧时间对探讨物种起源与演化具有重要意义。通过最大似然法（ML）构建物种进化树以及估算物种分化时间在比较基因组学的研究进展中已经成为了必不可少的“套路...

生信师姐

生物多样性包括 物种多样性、遗传多样性和生态系统多样性，其成因是生物学中的核心问题之一。陆地环境中，山区生态系统蕴藏着异常多样的陆地生物多样性，可能的解释包括巨大的海拔梯度变...

Mr_我爱读文献

前几天，实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的选择压力分析，没想到却在多序列比对这一环节出现了棘手的问题。...

xuzhougeng

基因组组装 基因组组装一般分为三个层次，contig, scaffold和chromosomes. contig表示从大规模测序得到的短读(reads)中找到的一致性序列。组...

生信师姐

转自：https://mp.weixin.qq.com/s/8t7rNrp82tnoTW5LN_ck3g[https://mp.weixin.qq.com/s/8t7rNrp...

九心_

前言 无论是写代码还是脚本，当我们要处理字符串或者提炼重要信息的时候，正则表达式都可以是我们的好帮手。 不过很多同学都有一种这样的感触，正则 = 天书 ，比如下面的邮箱表达式...