每次上网搜集资料最头疼的发现资料好零散,要么没有找到答案,要么有些问题别人问了但是没人解答。为了方便大家更好的用pro软件学习插画或者用插画画出自己的所想所感,特意整理了新手...
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Genome engineering using the CRISPR-Cas9 system 这篇文章真的看了好久,就算一开始秉承着不求甚解的精神都看不下去,有太多的专业背...
现在的技术真的是越来厉害了,而且相比于以往复杂的操作 现在的黑科技仿佛特别“亲民” 比如 我之前发过在“baidu”后面加“wp” 就能高速下载百度云资源 而且自己不需要登陆...
Biomarker有助于疾病诊断、判断疾病分期或者用来评价新药或新疗法在目标人群中的安全性及有效性。此前小编给大家解读了一篇针对过敏性哮喘疾病,利用WGCNA,鉴定关键模块和...
本文应该是第二全的WGCNA分析教程,参考了最新的文档。第一全的还在路上,会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上,欢迎点击链接了解更多。 WGC...
看这个之前,可以先看WGCNA的一些理论背景知识[https://www.jianshu.com/p/e102681ec979]看完整个之后可以去看WGCNA关键模块和hub...
WGCNA debug 运行到这里报错:Error in (new("standardGeneric", .Data = function (x, y = NULL, use...
已解决,这里面涉及超多问题,发现很多人都遇到这个,是WGCNA包与其他函数冲突导致的;输入
cor <- WGCNA::cor
暂时分配功能
再运行
blockwiseModules
后面再调回来
cor<-stats::cor
STEP6:WGCNA相关性分析因为样本数量比较可观,所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析,挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合,或者显著差异表达的基因集合等等。...
net = blockwiseModules(datExpr, power = sft$powerEstimate,
maxBlockSize = 6000,TOMType = "unsigned",
minModuleSize = 30,reassignThreshold = 0, mergeCutHeight = 0.25,
numericLabels = TRUE, pamRespectsDendro = FALSE,
saveTOMs = TRUE,
saveTOMFileBase = "AS-green-FPKM-TOM",
verbose = 3)
运行到这里报错:
Error in (new("standardGeneric", .Data = function (x, y = NULL, use = "everything", :
unused arguments (weights.x = NULL, weights.y = NULL, cosine = FALSE)
请问有遇到这种情况吗,不知啥意思
STEP6:WGCNA相关性分析因为样本数量比较可观,所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析,挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合,或者显著差异表达的基因集合等等。...
因为样本数量比较可观,所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析,挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合,或者显著差异表达的基因集合等等。...