经典的GWAS原理图,补一个在这里 GWAS是找与当前性状相关的snppheWAS是找与当前snp相关的性状 那么这样看,GWAS可以通过单个研究来做,pheWAS基本上就是...
经典的GWAS原理图,补一个在这里 GWAS是找与当前性状相关的snppheWAS是找与当前snp相关的性状 那么这样看,GWAS可以通过单个研究来做,pheWAS基本上就是...
降维聚类,类型鉴定,差异分析 近年来,单细胞测序的成本逐渐降低,使得大众研究从组织水平转移到单个细胞水平的分析成为可能。本文主要是简单介绍一下SingleCellRNAseq...
大家好,孟德尔随机化很多人都是从TwoSampleMR包入手学习的,很多GWAS的概念如果不搞清楚,写SCI的时候容易犯一些概念性的错误,低分的杂志可能大家都很水,可能也就一...
数据整理 因为这个是我学生的真实数据,所以就不方便放出来给大家做示例文件了,可以只看代码,或者拿自己的数据练练手。 975个基因做不出GO富集,我的第一反应是孩子学艺不精,然...
VCF (variant callformat) 文件记录了所有样品基因组中所有位置变异(主要包括SNP和InDel)信息。后续几乎所有分析内容都是基于此文件,如进化树分析、...
多组学分析:在基因表达、表观遗传、蛋白、单细胞及微生物组学等水平上,利用组学数据比较不同组学水平的疾病和健康对照,从而鉴定潜在的致病机制。 药物靶点孟德尔随机化分析:探究是其...
首先介绍下各个ID的转换,比较便捷的有: 1.在线的:Uniprot : ID mapping 工具,可以批量转换和下载https://www.uniprot.org/id-...
因为我自己研究的领域跨单细胞、QTL、以及孟德尔随机化,所以就一直在思考这个问题:单细胞能不能和孟德尔随机化联合起来研究? 这方面的文章或者研究比较少。两个组学能够联合我能想...
前面已经简单介绍过GWAS的概念,GWAS分析中所用到的文件以及分析流程,我们在GWAS分析结果文件中经常会看到beta值和P值,他们分别代表什么意思?这两个值又有什么关系呢...