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本篇文章是为了记录本人在系统发育实验和数据分析过程中,所使用过的以及部分未使用但如雷贯耳的软件的集合。当然,相对于整个系统发育软件之汪洋大海,此处不过一滴水! 1. 数据获取...
在开始对比时,使用如下参数 出现如下错误BAMoutput.cpp:27:BAMoutput: exiting because of OUTPUT FILE error: c...
要做选择性消除分析,首先就要把如下的理论记住熟记于心。 中性进化假说: 分子水平上,生物的演化或物种的进化并不是自然选择引起的,而是由中性/近中性的突变等位基因经过遗传漂变引...
KNN的优点 1、KNN算法是一个非常简单的算法,理论成熟,思想简单,既可以用来做分类也可以用来做回归 2、天然解决多分类问题,也可用于回归问题 3、和朴素贝叶斯之类的算法比...
叶绿体基因组的文章中通常会有一小部分内容是运用DnaSp软件来进行核苷酸多态性π分析,断断续续看了也好长时间了,今天终于重复出了结果,简单记录自己的重复过程: 论文:comp...
写在前面 我知道IQ-tree已经有很长一段时间了。不过我一直并没有使用它。主要原因是,常用的快速构建ML树的软件是FastTree,如果要求准确,我会在服务器上使用RaxM...
在日常数据分析过程中,我们经常碰到如下所示数据:第一列为名称,第二列为数值。 NameValueA56B58C26D34E76F98 如上两列数据可以作哪些可视化图表呢? 一...