240 发简信
IP属地:内蒙古
  • 大神,咱俩看的应该是一个老师讲课的视频,那个pop文件是怎么搞的?自己做的吗?

    群体结构——PCA分析

    概念 PCA(principal components analysis)即主成分分析。主成分分析也称主分量分析,旨在利用降维的思想,把多指标转化为少数几个综合指标。 在统计...

  • 您好,plotQ的quiet=T提示参数不对,请问是怎么回事啊

    基于vcf文件进行Admixture群体结构分析

    ADMIXTURE 是常用的群体遗传学分析工具,可以估计个体的祖先成分。与 STRUCTURE 相比,它的速度更快。Admixture分析举例: Admixture中群体的亚...

  • GWAS分析-说人话(14)- 如何查看SNP的基因型

    前言 这年头,谁还TM的做GWAS~ 今天导师不是想和你看流星雨, 是想和你看看他感兴趣SNPs在某个亚组数据中的基因型....... 怎么办? I have 一堆SNPs,...

  • 120
    GWAS分析-说人话(3)网络数据下载后的处理

    前言 上天会告诉你那个文件才是需要用的吗? 不会! 但我会!(点个赞,大个赏呗~) 数据下载后,相信我,小白连看哪个数据都会不知道的! 当然,数据分析的第0章,数据下载,也不...

  • 120
    CRISPR-Cas9基因编辑技术简介

    CRISPR-Cas9是继ZFN、TALENs等基因编辑技术推出后的第三代基因编辑技术,短短几年内,CRISPR-Cas9技术风靡全球, 成为现有基因编辑和基因修饰里面效率最...

  • 120
    RNAseq常规流程

    转录组分析是生信分析的一个基础和常见的分析流程,一般从下机数据开始,经过一系列的质控,基因组比对,差异分析等过程得到实验组与对照组(或者肿瘤中的转移组和原癌组)中差异表达的基...

  • 120
    生信分析学习笔记 - RNAseq (四) trimmomatic

    声明:本文部分内容和部分图片来源于网络。本文为生信小白学习笔记,不能保证专业名词和内容全部正确或权威。 下图为某一条RNAseq从数据预处理,序列回帖到数据可视化的工作流程,...

  • 您好,我是一名研一的生物学研究生,有读博的打算,目前在自学Linux和python,也学习了一些转录组分析软件和知识,想转去生物信息学方向读博,请问一下联系导师的时候难度大吗?研究生期间需要怎么准备呢?谢谢

    使用TransDecoder寻找转录本中的编码区

    TransDecoder能够从转录本序列中鉴定候选编码区。这些转录本序列可以来自于Trinity的从头组装,或者来自于Cufflinks或者StringTie的组装结果。 软...